（2）第十二条增加一款，作为第二款：“申请者在申请品种审定过程中隐瞒有关情况或者提供虚假材料的，三年内不受理其申请。”
（3）第十三条第（三）项增加：“已经取得植物新品种权的品种，申请品种审定的，应当使用植物新品种权公报公告的名称；已审定通过的品种，申请国家或者其他省、自治区、直辖市审定的，应当使用原公告的品种名称；”
（4）第二十四条第三款增加：“禁止在生产、经营、推广过程中擅自更改该品种的通用名称。”
（5）第二十六条修改为：“审定通过的品种，在使用过程中如发现有不可克服的缺点或者种性严重退化，不宜在生产上继续使用的，由原专业委员会或者审定小组提出停止经营、推广建议，经主任委员会审核同意后，由品种审定委员会进行不少于一个月的公示。公示期满无异议的，由同级农业行政主管部门公告。
自公告发布之日起，该品种种子停止生产；公告发布一个生产周期后，该品种种子停止经营、推广。”
3.
农村合作经济内部审计暂行规定（1992年5月12日农业部令第11号发布）
修改内容：（1）将本规定的名称改为《农村集体经济组织审计规定》，将规定中所有的“农村合作经济”改为“农村集体经济组织”。
（2）将第一条立法依据“《
中华人民共和国审计条例》”修改为“《
中华人民共和国审计法》”。
（3）将第二条“全国农村合作经济组织审计工作的指导机构，是农业部农村合作经济指导司”修改为“农业部负责全国农村集体经济组织的审计工作”。
（4）将第三条“县级以上地方人民政府农村合作经济经营管理部门（以下简称农村经营管理部门）负责指导农村合作经济的审计工作”修改为“县级以上地方人民政府农村经营管理部门负责指导农村集体经济组织的审计工作；乡级农村经营管理部门负责农村集体经济组织的审计工作。”
（5）删除第四条。
（6）将第七条修改为：“农村集体经济组织审计机构的审计监督范围为村、组集体经济组织。”
（7）第八条第（六）项修改为“承包费等集体专项资金的预算、提取和使用情况”；第（七）项修改为“村集体公益事业建设筹资筹劳情况”；删除第（十一）项。
（8）删除第九条、第十条。
（9）将第二十八条“由省、自治区、直辖市农村集体经济组织审计机构的主管部门会同同级财政、物价主管部门制定”修改为“由省、自治区、直辖市农业行政主管部门会同同级财政、物价主管部门制定”。
4.
农业转基因生物安全评价管理办法（2002年1月5日农业部令第8号发布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
修改内容：在第二十四条增加一款作为第三款：“农业转基因生物安全证书上的转基因生物名称，应当符合农作物品种审定命名的要求。”
5.
无公害农产品管理办法（2002年4月29日农业部、国家质检总局令第12号发布）
修改内容：在第三十七条增加一款作为第二款：“法律、法规对处罚另有规定的，从其规定。”
6.
联合收割机跨区作业管理办法（2003年7月4日农业部令第29号发布，2004年7月1日农业部令第38号修订）
修改内容：删除第二十九条的“违反本办法第十三条规定”，删除第三十条“违反本办法第十四条、第十五条规定”，删除第三十一条“违反本办法第十九条规定”。
7.
动物源性饲料产品安全卫生管理办法（2004年8月2日农业部令第40号发布）
修改内容：将第七条第一款中的“省级人民政府饲料管理部门收到《动物源性饲料产品生产申请书》及其相关材料后”修改为“省级人民政府饲料管理部门受理申请后”；第二款修改为：“申请材料不齐全或者不符合规定条件的，应当自收到申请材料之日起5个工作日内一次告知申请人需要补正的全部内容。”
