4月份发生的事到现在还能投诉吗

我是昆山滨中元川金属制品有限公司的一名员工，今年4月9号，我因为上夜班打瞌睡，过了一天又打瞌睡，我的基本底薪是1500元，被公司罚款607元，并扣除我当日（两天）工资及加班费，此时的公司规章制度没有这一规定，2008年7月才加上这一条的。我很郁闷，这样合理吗？如果要罚是按我的底薪还是按我的综合工资的20%罚款？过了近半年了，我还能投诉吗？另外，我今年的年休假有5天，公司规定是一个月休息一天，分5个月休完，我已经休息了两天，现在已经离职，还剩3天未休，请问还剩3天是否可以要求付给我加班费？按300%算吗？