附加合同履行吗

你好我于2001年到公司工作，至今已经八年了，三年前我因买房缺钱向公司借了五千元钱，公司说如果我签两年合同，五千元就可不用还了，说是公司福利，然后合同有一项是说如果我中途辞职都向公司赔偿，后来我签了，因为以前的合同未到期，所以就续签到今年年底，可在去年初时原公司法人把公司卖给了别人，并且去年所有人没有年假，我们问了，公司说法人换了，我们都是新员工了，所以没有年假。而今年因为种种原因，我想辞职了，公司提出让我偿还哪些钱。　　我想问的问题是：　　我的这个附加合同还有效吗？要赔偿给公司吗？　　不让员工休年假合理吗？　　我应该怎么做？