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㈤ 行政政法科。
承担行政、政法、外事、军队、武警等方面的部门预算有关工作，并拟订相关的财务管理实施办法；拟订行政性经费开支标准和定额，审核分管部门（单位）年度预算、专项资金预算和年中追加预算建议；拟订部门（单位）和项目资金使用的财务管理办法；审批分管部门（单位）的年度财务决算；组织实施财政行政政法项目专项资金绩效考核工作。
㈥ 教科文科。
承担教育、科技、文化等方面的部门预算有关工作，拟订相关财政政策；按规定管理教科文事业发展财政专项资金，拟订相关资金管理办法；审批分管部门（单位）的年度财务决算；组织实施财政教科文项目专项资金绩效考核工作。
㈦ 农业科。
承担农业、畜牧业、林业、水利、农机、气象等方面的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策建议；负责财政支农政策的贯彻落实；参与自治州农业发展规划的编制，贯彻执行农口事业、企业财务管理制度及相关的实施细则，贯彻执行财政支农资金管理办法，并制定相应的补充办法；贯彻执行农业保险的有关政策；管理和分配财政支农资金，管理政策性农业专项贷款贴息，负责支农项目库建设；提出专项资金支出预算建议；审批分管部门（单位）的年度财务决算；组织实施农业项目资金的绩效评价工作。
㈧ 社会保障科。
承担人力资源和社会保障、民政、卫生等方面的部门预算工作，拟订相关财政政策建议；贯彻执行国家、自治区各项社会保障和就业及医疗卫生制度；承担自治州社会保障制度政策研究工作；参与编制州本级社会保障预算草案，拟订社会保障和就业及医疗卫生等专项资金预算建议；管理自治州本级统筹的财政社会保障专户资金，定期反映和报告收支执行情况；负责督促指导各项社会保险基金政策的落实和监管工作；审批分管部门（单位）的年度财务决算；组织实施社会保障项目专项资金绩效考核工作。
㈨ 会计管理科。
负责管理自治州会计工作；宣传和实施国家会计制度，拟订自治州会计管理的相关补充规定；负责组织全州高级会计师、注册会计师考试报名工作；负责注册资产评估师报名资格审查工作；负责实施全州会计信息化工作；负责组织会计类资格考试；负责自治州会计从业资格管理工作；负责自治州财政会计学会、珠算协会的工作。
㈩ 经济建设科。
参与拟订自治州建设投资的有关政策；拟订自治州基本建设财务管理制度，负责投资建设项目的财政财务管理；审核批复财政投资项目竣工财务决算；承担有关政策性补贴和专项储备资金财政管理工作；会同有关部门归口管理部门基金，拟订基金收支使用财务管理办法，审批年度预决算；拟订部门（单位）和专项资金财务管理办法；负责自治州政府信用平台管理工作；负责监督国有资产投资经营公司对政府信用贷款的使用；组织实施财政经济建设项目专项资金绩效考核工作。
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