指导全州社会团体和民办非企业单位的登记和管理工作。负责对全州性社会团体和州直民办非企业单位进行登记管理、年度检查和变更、执法监督工作；指导村（居）民委员会民主选举、民主决策、民主管理和民主监督工作，推动村（居）民自治和基层民主政治建设；指导城乡社区建设工作，推动社区服务体系建设；拟订全州社会福利事业发展规划，负责老年人、孤儿和残疾人等特殊群体权益保护；指导社会福利机构的工作，负责社会福利企业认定审批工作；负责本级社会福利彩票公益金资助项目的评审工作；接收并分配国内外对社会福利机构的捐赠；指导全州婚姻登记和殡葬管理工作，推进婚俗和殡葬改革；指导、协调生活无着的流浪乞讨人员救助管理工作。
㈢ 优抚安置科（自治州双拥领导小组办公室）。
负责各类优抚对象的优待、抚恤、补助和国家机关工作人员伤亡抚恤、革命烈士褒扬工作；负责全州退役士兵（含士官）接收安置工作；指导全州退役士兵（含士官）的培训、就业工作；承担自治州双拥工作领导小组的具体工作。
纪检（监察）组：负责机关和直属事业单位党的纪律检查和行政监察工作。
四、人员编制和领导职数
自治州民政局（民间组织管理局）机关行政编制12名，其中：县级领导职数4名（含纪检组长、社会组织工作委员会专职副书记）、内设机构科级领导职数6名。
按规定核定机关工勤事业编制2名。
五、事业单位
㈠ 博尔塔拉蒙古自治州低保救助救灾办公室。相当于科级，全额拨款事业单位，隶属于自治州民政局管理。列全额事业编制6名，其中：科级领导职数2名。
主要职责：健全城乡社会救助体系；负责最低生活保障、医疗救助、临时救助资金分配、落实、使用和发放工作的监管；组织和指导全州城镇无收入困难老年居民生活补贴发放；指导农村五保户供养和敬老院建设；拟订全州救灾减灾工作规划并组织实施；组织自然灾害救助应急体系建设；负责灾情信息上报、救灾款物管理、灾民安置，组织和指导州内救灾捐赠。
㈡ 博尔塔拉蒙古自治州区划地名委员会办公室。相当于科级，全额拨款事业单位，隶属于自治州民政局管理。列全额事业编制4名，其中：科级领导职数2名。
主要职责：拟订行政区划调整规划及变更方案，承办行政区划变更审核事项；勘定县市、乡镇两级行政区域界线，处理行政区域界线争议；实施自治州地名公共服务工程，制定全州地名工作规划，审核地名命名和更名，设置地名标志，开展地名普查，管理地名档案，建立地名数据库。
