（一）主管税务机关应加强对企业所得税年度纳税申报表的运用和分析，充分利用涉税通汇算清缴软件统计数据，及时核对相关涉税数据和资料，加强企业所得税管理。
（二） 严格按照上级要求，做好税前弥补亏损、不征税收入、政策性搬迁处置收入等上级规定项目的台帐管理。
（三） 认真组织企业所得税纳税评估。纳税评估是加强企业所得税管理工作的一项重要手段。汇算清缴后，各局应组织开展纳税评估工作，通过对企业申报资料的横向和纵向分析比对，发现企业疑点和异常情况，有针对性的实施纳税评估，堵塞征管漏洞，提高企业所得税管理力度。
（四）开展企业所得税专项检查，加强汇算清缴后续管理。专项检查是对纳税评估工作的延伸，汇算清缴后，各局应在评估的基础上，针对评估中发现的疑点和难点，深入企业开展专项检查。后续管理的重点包括连续亏损三年及以上企业；年度亏损额在100万元及以上企业；弥补亏损额在100万元及以上企业；历年税收检查中问题较多企业；同一法人控制关联企业实行企业所得税不同征收方式的企业；企业所得税税负较低且异常变化的企业；发生企业重组业务等生产经营情况变化较大的企业；减免税期满后由盈转亏的企业；会计、审计、资产评估、税务、房地产估价、土地估价、工程造价、律师、价格鉴证以及其他经济鉴证类社会中介机构等。
六、要做好清算企业所得税管理工作
对注销企业，按照税收政策规定需要进行所得税清算的，应在完成企业所得税汇算清缴后，进行企业所得税清算，不得以所得税汇算清缴替代所得税清算，杜绝在未进行汇算清缴、所得税清算之前办理注销税务登记。各局应认真审核企业的所得税清算申报表，督促企业如实申报清算所得，避免出现主附表零申报现象，切实提高清算申报质量。
七、做好汇算清缴总结工作
汇算清缴工作结束后，各局应认真总结本年度的企业所得税各项管理工作、各项企业所得税政策落实情况、汇算清缴数据分析，做好纳税申报资料的归集、整理， 撰写企业所得税汇算清缴专项工作总结报告，在2012年7月底前，将2011年度企业所得税汇算清缴工作总结和数据分析报告、各类汇总表报送省局所得税处。
总结报告的内容包括：
（1）汇算清缴工作的基本情况；
（2）企业所得税税源结构的分布情况；
（3）企业所得税收入增减变化及原因；
