竣工验收备案后，运营单位要向当地污水处理运行监督主管部门申请正式运行，并提供工程竣工验收备案、建设项目环保验收等相关材料。污水处理运行监督主管部门要对城镇污水处理厂的设施水平、管理制度、水质检测能力。和中控系统、自动监控基站的安装、联网、处理水质、水量情况等进行综合评估，并在收到申请之日起15个工作日内，对城镇污水处理厂是否达到正式运行标准下达书面批复。
第十条 污水处理运行监督主管部门对排入城镇污水收集系统的排水单位实施排水许可证制度。对排入城镇污水收集系统的主要排放口特别是重点工业企业排放口水量、水质进行监督和监测。环保部门要加大对向城镇污水收集系统排污企业的环境监管力度，检查排污企业的治污设施运转情况，确保达标排放。
排入城镇污水收集系统的工业废水要按规定在企业内进行预处理，去除重金属和其他有毒有害物质，达到国家、地方或行业规定的排放标准。
第十一条 污水处理运行监督主管部门要委派监管员，对运营单位的工作进行监管，对特许、委托经营协议或服务合同规定内容的落实情况实施现场监督。监管员要认真履行监管职责。
第十二条 污水处理运行监督主管部门要委托有计量认证资质的检测单位，对城镇污水处理厂的进出水水质、水量和污泥进行定期监测，建立监测档案，并将监测报告定期报污水处理运行监督主管部门。
环保部门要至少每季度开展一次监督性监测，自动监控基站运行服务单位要协助环保部门做好对自动监控基站的比对监测工作和在线监测数据的有效性审核工作。
第十三条 运营单位要按照《城镇污水处理厂运行、维护及其安全技术规程（CJJ60-2011）》和我省有关污水处理行业安全生产管理的规定，制定保障城镇污水处理厂正常运行的生产管理制度、安全生产制度、水质检验制度，制定停电、进水水质突变、水量突变、洪涝冰冻灾害、重要设备故障等特殊情况的安全运营应急预案，报当地污水处理运行监督主管部门和环保部门备案。
第十四条 运营单位要按照《省建设厅关于印发河南省城镇污水处理厂污水污泥检验监测管理办法（试行）的通知》（豫建城〔2007〕93号）规定，每月6日前向当地污水处理运行监督主管部门和环保部门报告上月进出水水质化验情况，确保达标排放。
