1.5.1 预防预警。自治县建立预防预警机制，对动物疫情实施监测和预警，预警级别分为一般（Ⅳ级）、较大（Ⅲ级）、重大（Ⅱ级）、特别重大（Ⅰ级）四级，颜色依次用蓝色、黄色、橙色、红色表示。
1.5.2 应急响应。各乡镇人民政府负责本辖区内的疫情监测和报告工作，县畜牧兽医局对重大疫情作出可疑、疑似等判定，报告县人民政府，作出应急响应。
1.5.3 应急响应终止。疫情扑灭后，县畜牧兽医局根据乡镇人民政府的请求，及时组织专家对突发重大动物疫情应急终止的提议进行评估，并向县人民政府提出建议，由县人民政府作出应急终止的决定。
2 组织指挥体系与职责
2.1 应急指挥机构与职责
县人民政府设立重大动物疫情防控指挥部，县人民政府分管副县长任指挥长，县政府办分管副主任、县畜牧兽医局局长任副指挥长，县委宣传部、县发改、财政、监察、交通、卫生、民政、公安、交警、商务、工商、技监等部门负责人为成员。具体职责是：研究决定全县重大动物疫情防控工作；统一指挥全县重大动物疫情的应急处置工作；部署和总结年度防控工作；具体实施本预案；督促各乡镇人民政府、有关部门落实本预案。
2.2 应急日常工作机构与职责
县重大动物疫情防控指挥部下设办公室，负责全县重大动物疫情处理的日常工作，县畜牧兽医局局长兼任办公室主任，办公室设在县畜牧兽医局。办公室主要职责：按指挥部决策，统一协调指挥疫情控制和扑灭工作；收集和分析疫情信息及疫情发展态势、传播规律，并按规定上报疫情，及时提出启动应急预案的建议；组织调拨应急防疫物资；组织协调有关部门和乡镇人民政府实施本预案。
2.3 县重大动物疫情防控指挥部成员单位职责
县委宣传部：负责重大动物疫情的防控宣传，坚持正确的舆论导向，严格重大动物疫情防控信息、新闻的发布和管理。
县畜牧兽医局：负责研究拟定全县重大动物疫情控制规划，研究制定技术对策；负责重大动物疫情监测和报告，依法划定疫点、疫区、受威胁区，提出封锁建议；负责动物及其产品检疫检验、执法监督、疫情监督和疫情管理工作；负责紧急免疫接种、消毒灭源、扑疫的技术指导和监督；负责动物防疫监督检查站（点）的监督管理；负责建立应急防疫物资储备库以及防疫物资的组织供应；负责组织成立疫情处理预备队和专家小组，培训防疫人员；负责防控工作的综合协调和县重大动物疫情防控指挥部的日常工作。
