第十一条 支出预算编制。各经费自理事业单位部门预算编制应按照“零基预算”的原则进行编制，其中人员工资福利性报酬应严格按市人力资源保障、市财政部门有关工资总额管理的要求进行编报；公用经费按我市全额事业单位有关标准予以编报；项目经费按照相关行业标准或实际业务需要进行测算编报，有政府采购计划的还应编报政府采购预算。
第十二条 预算的执行。经费自理事业单位应当严格按预算程序办事，及时足额征收各项收入，科学合理安排相应支出，不得随意、擅自追加和变更预算。
（一）收入收缴。各经费自理事业单位应当严格按照规定及时足额征收各项非税收入，确保预算收入按进度完成，保障各项支出需要。
（二）指标下达。按照“以收定支”的原则，财政部门根据经费自理事业单位年度收入征收计划及完成进度，下达各单位年度用款计划。为保证经费自理事业单位的正常支出，相关经费指标可以适当预下达。
（三）国库集中支付。经费自理事业单位各项支出应实行国库集中支付，即预算指标下达到零余额账户，以直接支付或授权支付的方式通过零余额账户将财政资金拨付到商品或服务的供应商，或拨付到最终用款单位。
（四）政府采购。涉及政府采购事项，各经费自理事业单位应严格遵守政府采购有关规定，按照“先预算、后计划、再采购”的工作流程，做好采购预算编制和采购计划执行。
（五）厉行节约。经费自理事业单位公车购置和运行、公款出国（境）、公务接待等严控类经费，参照党政机关和全额事业单位有关要求进行管理，确保严控类经费实现动态监管和规模总控，切实压减一般性开支。
（六）结余资金的处理。经费自理事业单位应当切实加强结余资金的管理，认真清理自有账户历年结转结余资金并进行分类处理。暂存款可按财务规定自行管理；非税收入和上级补助经费形成的结转结余资金，应当严格实行封闭管理，经报批方能使用；除非税收入以外的经营性等收入形成的结转结余资金，按财务规定和会计制度要求使用。从2011年起，各经费自理事业单位当年的结余资金，由财政部门视单位收入性质、结构及政府购买服务的需要，结转安排用于该单位下一年度支出或统筹使用。
第十三条 预算调整。经费自理事业单位年度预算执行中确因上级部门临时追加工作任务、履行职能需要及年度收入增减需调整年初预算时，应当按规定报主管部门同意后，由主管部门报财政部门，在年度预算调整时一并考虑。
