第九条 财政部门负责专项资金财务管理监督。制定或会同有关部门制定专项资金管理办法；审核或审定资金分配计划；对经批准的项目计划下达预算，审核拨款；对资金实行监督管理和组织绩效考评，出具绩效考评报告，抄送审计、监察部门。
第十条 审计部门负责对财政部门、业务主管部门和项目实施单位是否按规定分配管理使用专项资金以及履行监督职责情况进行审计监督；对财政部门、业务主管部门和项目实施单位落实审计意见整改情况进行监督检查。
第十一条 监察部门负责对本行政区域专项资金分配管理使用进行监督，依法对违反专项资金管理使用规定的单位、组织和个人进行查处。
第三章 分配使用
第十二条 对受理的专项资金申请，业务主管部门应当及时进行审查。对投资数额较大、专业性较强的项目，应当组织专家成立评审论证小组或者委托有专业资质的社会中介机构进行评估论证。对竞争性较强的项目，应引进竞争机制，采用政府采购方式，择优选择实施主体。对经济、社会和环境有重大影响的项目，应当向社会公示，广泛征求公民、法人和其他组织的意见。依法应当进行听证的，应当组织听证。
第十三条 专项资金分配应当坚持公开、公平、公正原则，按项目库排序选择，实行班子集体研究，严格按程序和权限审批。涉及到补助个人的专项资金，应当建立健全发放手续，实行公示制度，做到公开透明。
第十四条 属于上级下达的专项资金，财政部门和业务主管部门原则上应在收到上级下达资金的文件20个工作日内拟订资金分配方案。属于本级安排的专项资金，也要及时拟订资金分配方案。
第十五条 专项资金原则上实行国库集中支付。属于政府采购范围的，必须按政府采购管理程序办理。
第十六条 专项资金安排用于个人和家庭的补助，由财政部门按有关规定，授权专项资金使用单位，再由专项资金使用单位委托金融机构以“一卡通”或“一折通”等支付方式，直接发放到受益对象手中。对补助对象明确、用途单一的专项资金，实行“报账制”的支付方式。
