（十六）关于挂靠的分支机构管理问题
对挂靠（加盟）的分支机构，如不能完全按照《国家税务总局关于印发〈跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理暂行办法〉的通知》（国税发〔2008〕28号）文件规定提供相关资料，则主管国税机关有权按独立纳税人进行确认。
（十七）关于试点企业集团合并纳税问题
对实行合并纳税的试点企业集团，2009年度企业所得税的纳税申报和征收管理，应按照《财政部
国家税务总局关于试点企业集团缴纳企业所得税有关问题的通知》（财税〔2008〕119号）规定，停止执行合并缴纳企业所得税政策，按照新税法规定进行征收管理。
（十八）关于未纳入中央地方分享范围的企业汇总纳税问题
不实行《国家税务总局关于印发〈跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理暂行办法〉的通知》（国税发〔2008〕28号）办法未纳入中央地方分享范围的汇总纳税企业，在国家税务总局没有新规定前，继续按新税法实行前的规定执行。
四、纳税申报方面
（十九）关于固定资产加速折旧备案时间问题
新
企业所得税法实施后，实行固定资产加速折旧的纳税人应在实行加速折旧当年度第一次月（季）度预缴纳税申报时（或在申报期之前）向主管税务机关申请备案。
（二十）关于核定应税所得率征收企业年度申报问题
按照《
国家税务总局关于〈中华人民共和国企业所得税年度纳税申报表〉的补充通知》（国税函〔2008〕1081号）规定，实行核定应税所得率征收方式的企业年度申报时使用《
国家税务总局关于印发〈中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表〉等报表的通知》（国税函〔2008〕44号）中规定的《企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（B类）》，不必报送其他资料。
（二十一）关于一般企业不征税收入申报表填写问题
因《
国家税务总局关于〈中华人民共和国企业所得税年度纳税申报表〉的补充通知》（国税函〔2008〕1081号）填表说明规定“附表三第14行‘不征税收入’等于附表一（3）第12行‘不征税收入总额’”，故对一般企业取得《财政部 国家税务总局关于财政性资金 行政事业性收费 政府性基金有关企业所得税政策问题的通知》（财税〔2008〕151号）规定的不征税收入应填到附表三第19行“其他”中。
