1.准备阶段
准备阶段是指其他国家分离出新亚型流感病毒并发生病例，或卫生部已宣布启动应对准备行动的无应急反应阶段。
2.应急阶段
（1）蓝色预警，Ⅳ级应急反应阶段：其他省份发生人类感染新亚型流感病毒并发病，但未发生人传人。
（2）黄色预警，Ⅲ级应急反应阶段：本市发生人类感染新亚型流感病毒并发病，但未发生人传人；或外省发生新亚型流感病毒在人与人之间传播，但传播范围相对局限。
（3）橙色预警，Ⅱ级应急反应阶段：本市发生新亚型流感病毒在人与人之间传播，但传播范围相对局限；或市境外发生新亚型流感病毒出现较大范围传播。
（4）红色预警，Ⅰ级应急反应阶段：本市发生新亚型流感病毒在市内人群中持续快速地传播，有可能在短时间内向较大范围扩散或影响多个地区；卫生部或世界卫生组织宣布发生流感大流行。
3.结束阶段
本市发生的新亚型流感疫情得到有效控制；或卫生部判定流感大流行得到有效控制，则应急响应工作结束。
二、组织指挥体系及职责
（一）流感大流行应对工作领导小组
市、县（特区、区）人民政府成立流感大流行准备与应急工作领导小组（以下简称领导小组），政府分管领导担任组长，负责准备与应急工作的统一领导和指挥。领导小组成员由卫生、财政、经贸、物价、教育、公安、交通、工商、农业、畜牧、食品药品监管、民政、宣传、劳动保障、供电、通信、环保、铁路、武警、驻地部队等部门和系统组成。领导小组下设办公室在当地卫生行政部门。领导小组办公室主要职责是承担领导小组日常工作，向领导小组提出启动预案的建议，承担领导小组交办的其它具体事务。
领导小组成员单位主要职责：
卫生部门：为应对工作牵头部门。一是负责领导、协调本辖区内卫生行政部门、疾病预防控制机构、医疗机构和卫生监督机构做好流感大流行预防控制、医疗准备和应急处置工作，建立有效的工作机制、责任制和责任追究制；制定应对流感大流行年度准备工作计划；加强流感监测工作和监测系统建设；做好医疗救治和公共卫生干预准备工作；定期组织卫生部门流感防治专家组分析、评估流感疫情，及时鉴定和评估新流感病毒；定期对准备工作落实情况进行督导检查等。二是配合同级政府有关部门，建立流感监测信息交流机制和渠道；共同做好疫苗、药品储备；积极开展流感预防控制技术研究及交流活动。三是及时根据上级卫生行政部门授权，公布有关流感监测信息，发出预警，提出相关措施建议。
财政部门：将流感大流行应对经费纳入财政预算并及时拨付，做好经费使用情况监督检查工作。
