（十一）全面实施排污许可证制度。贯彻实施《广东省排污许可证实施细则》，逐步完善排污许可证管理的规范和制度，2010年前完成国控、省控和市控重点源排污许可证的发证、换证工作。建立各类重点污染源档案和各级污染源信息数据库，开展重点污染源普查动态更新。
（十二）落实结构减排措施。协助有关部门建立健全落后产能退出机制，加大火电、钢铁、水泥、造纸、酒精、漂染、电镀等行业落后产能的淘汰力度，严防已淘汰的落后产能死灰复燃，确保完成“十一五”落后产能淘汰任务。抓好电力、水泥工业“上大压小”和清洁能源替代工作。
（十三）开展“十二五”总量减排研究。总结“十一五”污染减排工作，按照国家“十二五”总量减排工作的思路和要求，积极探索未来全省污染物总量减排新措施与新管理机制体制，开展“十二五”控制因子现状与减排潜力研究。
三、以东江水质保护为重点，加强水环境综合整治
（十四）扎实抓好东江水质保护工作。认真贯彻落实《关于进一步加强东江水质保护工作的意见》，加快东江流域环境基础设施建设，强化工业污染源监管。继续抓好淡水河、石马河、潼湖水系等东江重要支流的污染综合整治工作，2010年底前，淡水河和石马河流域各镇全部建成污水处理设施；科学合理划定畜禽养殖的禁养区和限养区，制定规模养殖业退出计划，积极稳妥清理禁养区内的畜禽养殖业。加强东江重要支流水质监控，排查重要支流排污口情况，强化流域应急管理工作。
（十五）切实加强饮用水源保护。深入开展饮用水源水质监测和环境安全风险隐患排查，对全省重点水库及入库河流水质状况进行调查评价，制定饮用水源生态安全监控预警、风险管理和控制措施。
（十六）继续推进水环境综合整治。根据珠江综合整治“八年江水变清”的目标要求，对流域各市完成情况进行考核、评估和总结。完成《广东省水环境功能区划（试行方案）》的修编工作。加大跨界河流污染整治力度，着力推动练江、独水河等重点流域、区域污染整治规划实施。完善跨界河流交接断面水质目标管理细则，对交接断面水质达标情况进行考核。
（十七）加强海洋污染防治。组织编制“十二五”碧海行动计划。进一步加强海洋污染防治，严格近岸海域环境管理，继续推进陆源污染防治、海洋生态环境保护工作。
四、以亚运会空气质量保障为重点，推进区域大气污染联防联治
