市新农合办办公经费应纳入财政预算，不得挤占挪用合作医疗基金。市新农合办应认真执行财政部、卫生部《关于印发新型农村合作医疗基金财务制度的通知》（新财社〔2008〕59号），建立完善基金预、决算制度、财会核算制度、审计制度。新农合基金决算截止时间为每年12月31日。
第二十五条 合作医疗基金实行市级统筹、分级核算、总量控制、节余滚存的办法，基金节余控制在10%以下。
第二十六条 全市合作医疗基金实行集中管理，分别建帐，分灶支出、管支分离的模式运行，原则上互不挤占、挪用。
第二十七条 农牧民参加合作医疗应进行注册登记，凭《新农合证》就诊，门诊、住院所发生费用与补偿均应在《新农合证》上如实登记。
第七章 定点医疗机构管理
第二十八条 合作医疗定点医疗机构确定的原则：方便农牧民就医；兼顾中医民族医药、专科与综合相结合，医疗机构类别等级；注重发挥县（区）、乡、村三级农村卫生服务网络作用。
第二十九条 定点医疗机构应具备下列条件：
（一）取得《医疗机构执业许可证》；
（二）从业人员应具备相应的执业资格；
（三）严格执行国家和自治区物价部门规定的医疗服务价格和药品价格标准，执行合作医疗的有关政策和规定，建立与合作医疗制度相适应的内部管理制度，配置符合要求的计算机管理系统；
（四）具备较高的服务质量和良好的服务态度；
（五）自愿申请成为定点医疗机构。
第三十条 合作医疗定点医疗机构按规定审查确定后公布。
第三十一条 各医疗机构应严格住院标准和住院指征，不得因效益原因降低住院门槛，造成合作医疗基金流失，对已提出住（转）院申请的患者应尽快予以研究，以免延误病情。
第三十二条 定点医疗机构要严格执行《自治区新型农牧区合作医疗基本药品目录（2010年版）》、《自治区新型农牧区合作医疗服务设施及诊疗项目目录（2010年版）》（以下简称“三个目录”）。
各级定点医疗机构要严格控制自费药品、自费检查项目的使用和自付医药费用占总医药费用的比例。县（市）及县（市）以下定点医疗机构，新农合目录外药品和诊疗费用占医药总费用的比例不得超过10%，县（市）以上定点医疗机构不得超过15%；县（市）及县（市）以下定点医疗机构，使用新农合目录外药品的金额应控制在其药品总费用的10%以内；县（市）以上定点医疗机构应控制在25%以内。对定点医疗机构超范围、超标准诊疗发生的不合理费用，一经核实，由定点医疗机构自行承担。各级定点医疗机构要根据自身实际，制定并落实对参合农牧民的各项优惠政策和措施。
