（一）住院统筹基金：主要用于对参合农牧民住院可报费用达到起付线标准的补偿、门诊大病（重大慢性病）的补偿以及住院分娩的定额补偿。原则上住院统筹基金占提取风险基金后统筹基金的70%左右。
（二）门诊统筹基金：主要用于参合农民普通门诊和一般慢性病的补偿，原则上占提取风险基金后统筹基金的30%左右。
（三）风险基金：主要用于弥补基金非正常超支造成的基金临时周转困难等，原则上风险基金要保持在当年统筹基金总额的10%，由市财政部门、卫生部门共同管理。合作医疗风险基金按乌鲁木齐县、乌鲁木齐市辖区、米东区三部分总量分别提取及使用，一旦基金出现超支，按三部分分别动用各自的风险金，原则上互不挤占、挪用。风险金不能弥补时，由乌昌财政及各区（县）财政共同分摊弥补。
第五章 补偿模式、比例及范围
第十七条 全市合作医疗补偿模式确定为“住院统筹＋门诊统筹”的补偿模式。
第十八条 门诊补偿：参合农牧民须持《新农合证》在乡村定点医疗机构门诊就诊。慢性病参合患者持《新农合证》和《慢性病就诊簿》在乡镇、县级定点医疗机构就诊。
（一）普通门诊医药费用补偿。
1.补偿范围：肌肉注射、静脉注射、灌肠、换药、小型清创缝合、针灸及拔火罐等常规治疗费；B超、心电图、放射、化验等常规检查费；《自治区新型农牧区合作医疗药品目录（2010年版）》（村级、乡级）内的药品费。
2.门诊补偿比例：乡镇级定点医疗机构的单次门诊费用补偿比例为30%，单次门诊补偿封顶额为11元，每人年门诊补偿封顶额为500元；村级定点医疗机构单次门诊费用补偿比例为40%，单次门诊补偿封顶额为6元，每人年门诊补偿封顶额为300元。实行单处方限量（即每3天享受一次补偿），参合农牧民年内门诊就诊次数不限。
参合农牧民在乡镇级定点医疗机构就诊使用新农合目录内的国家基本药物（基层部分）的费用，可在同等补偿比例基础上提高5个百分点进入补偿范围核算。
（二）慢性病门诊医药费补偿。
1.补偿病种：糖尿病（Ⅱ型）、高血压（2期及以上）、脑出血及脑梗塞恢复期、肺心病、风湿类心脏病、冠心病、恶性肿瘤、肾功能衰竭、精神病、克汀病、结核病、包虫病、布鲁氏杆菌病。
2.补偿范围：适用于治疗慢性病所需的医疗费用及《自治区新型农牧区合作医疗基本药品目录（2010版）》（乡级、县级）范围内的药品费。
3.确诊程序：患者向乌鲁木齐市新型农牧区合作医疗管理办公室（以下简称“市新农合办”）提出申请，并提供二级甲等及以上医疗机构出具的有效疾病诊断证明书和相关检查报告。经市新农合办审核、登记并报市卫生局批准后，发放《慢性病就诊簿》。
