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(五)农村卫生管理处(市新型农村合作医疗管理办公室)
组织实施农村基本卫生保健和新型农村合作医疗有关政策、规划；承担指导农村卫生服务体系建设和乡村医生相关管理工作；监督指导农村卫生政策的落实。
(六)社区卫生与妇幼保健处
组织实施社区卫生与妇幼卫生的政策、规划；牵头组织预防和减少出生缺陷与先天残疾工作；促进基本公共卫生服务均等化工作；承担医疗保健机构开展生殖健康和计划生育技术服务监督指导工作。
(七)医政处
组织实施医疗机构、医疗技术应用、医疗质量和服务、采供血机构管理等有关政策、规划、规范、标准；指导医院药事、临床重点专科建设、护理管理、医院感染控制、医疗急救体系建设、临床实验室管理等有关工作；承担医疗机构医疗服务监管，建立医疗质量安全控制评价体系。
(八)食品安全综合协调与卫生监督处
承办食品安全综合协调工作，组织查处食品安全重大事故；组织实施食品安全标准及落实食品及相关产品的安全风险评估、预警工作；依法及时上报重大食品安全信息；按照职责分工承担职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生的监督管理；承担公共场所、饮用水、传染病防治等卫生监督管理；承担组织查处医疗服务违法行为；承担督办重大医疗卫生违法案件。
(九)药物政策与基本药物制度处
组织实施药品法典和国家基本药物制度；拟订基本药物和增补药物的遴选、采购、配送、使用的政策措施；承担拟订药品采购相关规范工作。
(十)中医处
组织实施中医药事业发展规划、计划以及管理规范和技术标准；指导中医、中西医结合医疗机构的中医药工作。
(十一)科技教育处
组织实施重点医学科技、教育发展规划；指导重点医药科研项目攻关，推广医学科技成果；承担省级医学重点学科专业建设工作；承担医药卫生实验室生物安全的监督工作；指导卫生专业技术人员培训工作。
(十二)市爱国卫生运动委员会办公室
承担市爱国卫生运动委员会的具体工作，统筹协调各成员单位工作职责的落实；承担创建卫生城市(镇、村)工作；承担农村改厕工作；开展群众性卫生监督管理和卫生检查工作；拟订健康教育规划，承办健康教育管理工作；承担组织开展除害防病工作。
(十三)行政许可服务处
承办本部门行政许可及行政审批事项。
(十四)组织人事处
负责局机关和指导直属单位的机构编制、人事工作；负责局机关和指导直属单位离退休人员工作，组织实施全市卫生专业技术人员资格考评工作。
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