（五）负责保护区内重点区域非法采砂和用地、违法使用滩涂、影响河道和堤坝安全、违规排放污染物等问题的经常性巡查和处理。
（六）负责保护区内水利设施、生态设施和环境保护项目的建设、管理和维护。
（七）编制保护区内采砂规划，综合管理保护区内河道采砂工作。
（八）在省防汛抗旱指挥部领导下，协调保护区内防汛抗旱工作。
（九）监督管理保护区内林木砍伐工作；负责保护区内退耕绿化、湿地保护、生态建设、水土流失防治和野生动物保护工作；负责保护区内农药和渔业捕捞管理；负责保护区内土地权属管理。
（十）承办省政府交办的其他事项。
三、内设机构
根据上述职责，省凌河保护区管理局设5个内设机构：
（一）办公室（法制与宣传处）。
负责机关文电、信息、安全保卫、资产管理等工作；负责机关日常工作的协调和督查；负责机关的人事管理、队伍建设等工作；起草保护区管理的地方性法规和规章；承办行政复议、行政诉讼工作；组织开展保护区宣传教育工作；负责信访工作。
（二）建设规划财务处。
拟订保护区保护的中长期规划及河道治理规划等相关专业规划；拟订保护区内水利设施、环境保护项目建设规划，负责相关可行性研究工作；负责保护区建设资金的筹措、使用和管理；负责机关财务管理；拟订保护区内水利、生态、环境保护设施管理、维护制度并监督实施；管理保护区内水利、生态、环境保护等项目建设和维护，组织项目质量监督和工程验收；负责保护区内渡口管理工作。
（三）水政监察处。
负责保护区内水政监察和水行政执法工作；负责保护区内重大、跨地区水事违法案件的查处；协调保护区内地区间的水事纠纷；综合管理保护区内河道采砂和清淤；监督管理保护区内河道安全，组织开展保护区内违法违规建房及其他建筑物的清理拆迁工作；负责保护区内重点区域乱采乱挖和影响河道、堤坝安全等问题的经常性巡查；协调保护区内防汛抗旱工作。
（四）环境监察处。
组织开展保护区内水质、水量和污染物排放监督管理，配合有关部门发布保护区内水质、水量和环境信息；负责保护区内重点区域违法排污、水质和水量、环境的经常性巡查；负责保护区内建设项目环境影响的评价工作；负责保护区内重大、跨地区环境污染案件的查处工作；拟订有关污染防治规划；审定水域纳污能力，提出限制排污总量意见和污染防治方案；协调治理跨地区凌河支流入口区域环境污染问题。
