（四）测算收支，核定补偿经费。县（市、区）财政、卫生等部门依据基层医疗卫生机构承担的工作任务量、完成任务情况和人员编制情况，合理核定基层医疗卫生机构的收入和支出，对收支差额给予补助。财政补助采取“当年预拨，次年考核结算，多退少补”的方式拨付。
四、保障措施
基层医药卫生体制综合改革涉及面广、政策性强，时间紧、任务重，各县（市、区）要从讲政治的高度，充分认识这项改革的重要意义，周密部署，统筹安排，保证各项改革政策措施落实到位。鼓励县（市、区）按照本实施意见和配套文件的要求，结合实际，创造性地落实改革任务。
（一）加强组织领导，搞好协调配合。市医改领导小组统筹组织和协调基层医药卫生体制综合改革工作。各县（市、区）政府要高度重视，成立强有力的领导机构和工作班子，抓紧制定具体实施方案。各级发展改革、卫生、机构编制、人力资源和社会保障、财政、物价、食品药品监管等部门要密切配合，保证改革顺利实施。
（二）深入调查研究，科学制定方案。各县（市、区）要针对基本药物制度实施过程中可能出现的问题和矛盾，加强调查研究，缜密制定工作方案，及时采取应对措施。要根据当地基层医疗卫生机构的机构设置、核编定岗、全员聘用、绩效工资、经费补偿、药品招标采购配送等工作实际，制定实施方案。要以综合改革试点为契机，加快体制机制创新，积极总结和推广典型经验。
（三）落实补偿资金，切实保障到位。要本着突出重点、有保有压的原则，科学合理地安排财政支出，将改革所需资金纳入年度预算，并与医保基金的补偿水平相互衔接，确保政府举办的基层医疗卫生机构正常运转。随着经济发展和人民群众医疗卫生需求水平的不断提高。各级政府要增加卫生投入，使政府卫生投入增长幅度要高于经常性财政支出增长幅度。要加强监督管理，提高资金使用效率，建立健全基层医疗卫生机构财务公开制度，确保资金分配使用规范、安全、有效，严禁挤占、截留、挪用。
（四）加强指导监督，确保规范运行。要深入检查工作进度和资金落实情况，确保基层医疗机构正常运转。要建立科学合理的监督检查机制，加强对基层医疗卫生机构服务提供情况、服务质量、运行情况、财务管理情况、基本药物制度执行情况、药品集中招标采购配送情况、政府补助落实情况的监督检查，确保各项工作规范有序运行。要创新考核评价方式，逐步建立多方参与、协调高效、公开透明、公平公正的考核评价制度。对工作落实不到位的，要责令限期整改；违纪违规的，要严肃追究责任。
