2020年以前，重点实施以下六大工程。
（一）航道整治工程。疏浚整治我市境内的航道，使其通航能力大幅提高。重点整治涡河航道，大寺以上水域恢复通航，修建蒙城复线船闸，逐步使涡河航道达到四级标准。
（二）港口建设工程。坚持标准化、集约化、规模化、专业化的发展方向，发展公用码头，加快专业化码头建设，优化结构，提升功能。重点建设涡阳港区城关作业区码头、谯城港区大寺作业区码头、蒙城港区城关作业区码头、利辛港区阚疃作业区码头等，港口吞吐能力达到2000万吨。
（三）区域物流工程。重点建设涡阳、大寺、蒙城区域物流中心，逐步形成以临港工业区为依托、以港口为中心的货物集散网络。同时，加快货运站场建设进度，促进港口物流业发展。
（四）航运工程。继续推进船型标准化工程，着力提升航运服务水平。适应市场需求，加快水运业运力结构调整步伐。加快水运业转型升级，促进航运业规模化、集约化经营。
（五）船舶修造工程。加快发展适应市场需求、结构合理、特色优势明显的修造船业。实施船舶行业结构调整，强化船舶制造能力建设，形成内河船舶制造业基地。优先支持船舶骨干企业发展，促进船舶运输与船舶制造优势互补、共同发展。制定并实施涡阳造船产业园区规划，打造涡阳修造船产业集群。
（六）系统保障工程。建设水运管理、水上安全管理、数字航道、专业人才保障等四大系统，加强航运污染防治工作，打造安全、畅通、绿色、环保的水运发展保障体系。
四、完善水运发展的统筹协调机制
（一）加强水运发展的组织领导。市政府建立水运发展联席会议制度，分管副市长任联席会议召集人，市交通局、市发改委、市经委、市建委、市公安局、市财政局、市国土资源局、市水务局、市农委、市林业局、市旅游局、市环保局、市地税局等为联席会议成员单位。各部门要各司其职，加强配合，及时协调解决工作推进中出现的问题。充分调动全社会参与和支持水运发展的积极性，营造良好社会氛围，形成合力，促进水运加快发展。
（二）严格执行水运发展规划。要深入贯彻执行《安徽省内河航运发展规划》、《亳州港总体规划》，各县区、各部门在编制城市总体规划、城镇体系规划、产业布局规划、综合交通运输规划、土地利用总体规划、水利综合规划时要加强与水运发展规划的衔接，实施项目时要加强沟通和联系，严格执行标准，项目经依法审批后方可实施。
（三）严格港口岸线使用管理。按照“深水深用、浅水浅用”的原则，合理确定岸线功能，统筹安排港口、工业、城市生活、城市建设、旅游开发、生态保护和防洪排涝等岸线使用。本着适度超前的原则，预留出充足的岸线资源和陆域纵深地带，以满足航道、港口发展的需要。严把港口岸线审批关，确保港口岸线合理有效使用。
