（五）医疗器械监管处
监督实施医疗器械的法定标准；对持有《医疗器械生产（经营）企业许可证》企业和医疗器械使用单位进行日常监督管理；协助省局开展相关行政许可工作、推行医疗器械质量体系认证和产品安全认证制度；核发一类医疗器械产品注册证；负责监测医疗器械违法广告；组织医疗器械法律法规及相关管理规范和标准的培训工作；配合上级部门组织开展医疗器械不良事件监测和产品再评价。
（六）药品安全监管处
监督实施
药品生产质量管理规范、中药材生产质量管理规范及医疗机构制剂质量管理规范；监督实施药品（含中药民族药）、药用包装材料的法定标准；监督管理麻醉药品、精神药品、毒性药品、药品类易制毒化学品和药源性兴奋剂生产、经营和使用；负责对持有《药品生产许可证》、《医疗机构制剂许可证》企业的日常监督管理；配合上级部门对医疗机构制剂室的资格条件进行初审；组织药品法律法规及相关管理规范的培训工作；配合上级部门组织开展药品不良反应监测和药品再评价；协助做好有关药品注册管理的相关事宜。
（七）药品市场监管处
监督实施
药品经营质量管理规范；监督实施处方药与非处方药分类管理制度；负责药品市场秩序的监督管理工作；负责药品批发企业的资格初审和药品零售企业行政许可工作；监测药品广告；承担药品互联网信息服务和交易行为的监督管理工作；承担药品经营企业从业人员及农村药品“两网”监督员培训工作。
（八）财务处
制定财务管理制度；编制财务预算、决算；负责财务核算、资产管理工作；负责行政事业性收费及罚没收入的监督管理；指导所属单位的财务工作，对所属单位进行内部审计，负责财务人员业务培训。
（九）人事处
负责局机关的机构编制、人事管理、劳动工资和人才教育培训工作；指导所属事业单位的上述工作；负责实施执业药师执业资格制度的有关工作；负责组织实施相关专业技术职务的申报和审定工作；负责机关离退休人员的服务和管理工作；负责局党组的日常工作。
机关党组织按有关规定设置。负责机关和所属单位的党群工作。
纪检、监察机构市纪委派驻市食品药品监督管理局纪检组、市监察局派驻市食品药品监督管理局监察室。设纪检组长1名，纪检组副组长（监察室主任）1名，监察室副主任1名。
