第十一条 承办机关在收到协查、核查函后应在下列规定时限内完成协查、核查工作并向提出机关复函。
（一）怀疑假冒药品、医疗器械的协查、核查，应在收到后7个工作日内复函。
（二）关于经营资质、票据等购销渠道情形，需进一步调查处理的协查、核查，应在收到后15个工作日内复函。
（三）不合格药品、医疗器械检验报告书的协查、核查，属于发布质量公告前的协查、核查，应按照提出机关的时限复函，其他情况应在收到后15个工作日内复函。
（四）关于假劣药品、医疗器械追踪查源的协查、核查，应在完成调查核实或立案后5个工作日内复函。
（五）其他类型的协查、核查，应在收到后15个工作日内复函。
（六）紧急情况需要加急办理的，提出机关可通过电话、传真、电子邮件等方式预先沟通情况，先行协查、核查，后履行相应程序；特殊情况需要延长回函时间的，可由承办机关与提出机关商定。
第十二条 协查函、核查函及复函一般应采用挂号信的方式邮寄，需要加急的应当采用特快专递方式邮寄。
第十三条 在协查、核查工作中发现有违反药品监管法律、法规、规章规定的，承办机关除函告提出机关外，应按规定依法查处本辖区发生的违法行为。属于上级部门要求核查的案件，应及时上报案件的查处情况和结果。
第十四条 各级食品药品监督管理部门制发的协查、核查函件，不得擅自提供给相对人。
第十五条 提出机关未接到或未及时接到承办机关的复函，可直接向承办机关查询，也可通过承办机关的上级食品药品监督管理部门查询。
第十六条 确因案件需要，提出机关可以直接派人到承办机关要求协查、核查，但应按本规定要求办理，同时应符合食品药品监督管理有关案件管辖、移送的规定。
第十七条 有下列行为之一的，将相关责任人员交由监察机关查处：
（一）提出机关随意或假借办案名义提出协查、核查要求的；
