拟订全省卫生事业发展规划和专项建设规划，推动区域卫生规划工作；统筹规划与协调全省卫生资源配置，管理大型医用装备配置；提出医疗服务价格、药品价格、基本医疗保险费用结算等政策建议；组织拟订全省卫生装备管理办法和标准并组织实施；拟订药品和医疗器械采购相关规范；编报本部门预算、决算；负责厅机关和所属事业单位的财务会计制度建设、资金（资产）的监督管理与绩效评价工作以及内部审计工作。
　　（三）政策法规处。
　　负责综合性卫生政策研究；组织拟订全省卫生政策和标准；协调、组织和参与起草卫生地方性法规规章草案；承担机关有关规范性文件的合法性审查工作；承担有关卫生行政复议和行政应诉工作。
　　（四）卫生应急办公室（突发公共卫生事件应急指挥中心）。
　　拟订卫生应急和紧急医学救援规划、制度、预案和措施；指导、协调突发公共卫生事件的预防准备、监测预警、处置救援、分析评估等卫生应急工作；指导并组织开展急性传染病的防控和应急处置工作；协调对重大自然灾害等突发事件实施紧急医学救援；发布突发公共卫生事件应急处置信息。
　　（五）疾病预防控制处（省爱国卫生运动委员会办公室）。
　　拟订全省重大疾病防治规划、免疫规划和严重危害人民健康的公共卫生问题的干预措施并组织实施；完善重大疾病防控体系，防止和控制疾病的发生和疫情的蔓延；指导全省农村改水改厕的业务工作；承办省爱国卫生运动委员会办公室的具体工作。
　　（六）艾滋病防治工作处。
　　拟订全省防治艾滋病的规划和措施；组织协调和研究解决全省防治艾滋病工作中的重大问题和具体事务；负责艾滋病防治项目的组织实施和管理；承办省防治艾滋病工作委员会的具体工作。
　　（七）农村卫生管理处。
　　承担综合管理农村基本卫生保健和新型农村合作医疗工作，拟订有关政策、规划并组织实施；指导全省农村卫生服务体系建设和乡村医生相关管理工作；指导监督农村卫生政策的落实。
　　（八）妇幼保健与社区卫生处。
　　拟订妇幼卫生、社区卫生、健康教育的政策、规划、规范并组织实施；组织实施妇幼卫生技术标准；对妇幼卫生保健工作进行管理与指导；牵头组织预防和减少出生缺陷与先天残疾工作。
　　（九）医政处。
　　组织实施医疗机构、医务人员、医疗技术应用、医疗质量和服务、采供血机构管理等有关政策、规范、标准；指导医院药事、临床重点专科建设、医院感染控制、医疗急救体系建设、临床实验室管理等有关工作；参与药品、医疗器械临床试验管理工作。

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