承担全省医疗器械的研制、生产、流通、使用的监督管理工作；监督实施国家医疗器械标准；执行医疗器械产品分类管理目录；承担Ⅰ、Ⅱ类医疗器械产品的注册和监督工作；监督实施医疗器械临床试验、生产、经营质量管理规范和生产质量体系认证工作；承担医疗器械生产、经营许可的监督工作；发布医疗器械质量公告；审查和监测医疗器械广告；组织开展医疗器械不良事件监测、再评价和淘汰工作；依法承担医疗器械互联网信息服务和交易行为的监督管理工作。
（七）药品安全监管处。
组织实施国家药品分类管理制度；参与实施国家基本药物制度；监督实施中药材生产、药品生产、医疗机构制剂等质量管理规范；承担放射性药品、麻醉药品、毒性药品及精神药品、药品类易制毒化学品和药源性兴奋剂等监督管理工作；承担药品生产、医疗机构制剂配制等许可的监督工作；组织开展药品不良反应监测、再评价和淘汰工作。
（八）药品市场监管处。
监督实施
药品经营质量管理规范；依法负责药品批发、零售连锁经营许可、药品市场秩序的监督管理工作；监督实施处方药与非处方药分类管理；发布药品质量公告；审查和监测药品广告；依法承担药品互联网信息服务和交易行为的监督管理工作。
（九）计划财务处。
负责全省食品药品监管部门专项经费和国家、省投资项目的申报及监督管理工作；制定局机关和直属单位财务管理制度并组织实施；综合管理各类资金、资产产权和政府药品检测设备的采购工作；编报本部门预算、决算，负责局机关及所属单位的财务会计制度建设、资金（资产）管理与监督以及绩效评价工作；负责局本系统行政事业性收费及罚没收入的监督管理及内部审计工作。
（十）人事处。
负责局机关的机构编制、人事管理、劳动工资、教育培训等工作，并指导直属事业单位的上述工作；拟订全省食品药品监管系统教育培训规划、人才队伍建设规划和规章制度，并会同有关部门指导实施；实施执业药师资格认定制度；负责组织药学专业技术职务的评审工作。
机关党委 负责局机关和直属单位的党群工作和目标管理工作。设置机关党委办公室。
离退休干部处 负责局机关离退休干部工作，指导直属单位的离退休干部工作。
纪检监察机构
省纪委派驻省食品药品监督管理局纪检组、省监察厅派驻省食品药品监督管理局监察室。行政编制4名。其中，纪检组长1名，监察室主任1名。
