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县畜牧局：负责动物疫病的防治工作，开展对与人类接触密切的动物相关传染病的监测和管理工作。
县商贸旅游局：负责做好旅游团队及人员的宣传、登记和报告工作，防止甲型H1N1流感疫情在旅游团队中发生和跨地区传播扩散。
县质监局、县工商局：根据各自职责，负责监控动物产品加工、销售环节，严把市场准入关。
其他有关部门根据本部门职责和甲型H1N1流感应急处理的需要，组织做好紧急物资的储备、市场监管、污染扩散的控制及甲型H1N1流感应急指挥部交办的相关工作等。
2、镇应急指挥部的组成和职责
（1）镇应急指挥部的组成：镇应急指挥部由镇政府主要负责人担任总指挥，分管负责人任副指挥，镇属单位主要负责人任成员。
（2）镇应急指挥部职责
①负责对本行政区域内疫情应急处理的协调和指挥，做出本行政区域内疫情处理的决策，决定拟采取的重大措施等事项。
②根据应急处理工作需要，调配本行政区域内各类人员投入疫情防控工作。
③调配本行政区域内的物资、交通工具和相关设施、设备。
④协助县卫生局、县教委、县畜牧局和其他有关部门，做好疫情信息的收集调查和健康教育宣传等公共卫生措施的实施。
（二）日常管理机构
秀山县卫生系统甲型H1N1流感防控工作领导小组办公室设在县卫生局，负责全县甲型H1N1流感疫情应急处理的日常管理工作。
（三）医疗卫生机构职责
1、医疗机构
（1）负责开展对流感样病例、不明原因肺炎病例、高危人群的监测和报告工作。
（2）做好院内技术培训、消毒隔离、个人防护、医疗废弃物的处理工作，防止院内交叉感染和污染外环境。
（3）县人民医院和乡镇卫生院严格执行预检分诊制度，建立和规范发热门诊。
（4）县人民医院为我县甲型H1N1流感病例的定点收治医院。县人民医院成立由呼吸内科、传染科、中医药专家等相关专业技术人员组成的甲型H1N1医疗救治专家组；配备必要的专用转运车辆、抢救设备、药品、防护装备和技术准备工作。
（5）县传染病医院为我县集中医学隔离观察场所。
（6）定点医院对甲型H1N1流感病人实行先收治、后结算的办法，不得以医疗费用为由拒绝收治或延误治疗。
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