分四个步骤：1、各单位开展自查，对2008年以来政府投资项目、使用国有资金项目，特别是扩大内需项目进行全面自查，找出存在的突出问题，分析原因，提出治理对策，边查边改。2、归纳、整理、小结自查情况，并于2010年2月前将自查情况报自治区专项治理工作领导小组，自治区专项治理工作领导小组同时将自治区自查情况报自治区党委和中央专项治理工作领导小组。3、组成自治区专项治理工作检查组，对重点项目、重点环节进行督查。4、适时组织人员，对问题较多的项目进行暗访和回访活动。
第三阶段：督促整改（2010年4月— 2011年4月）
分三个步骤：1、针对排查中发现的问题，发放整改通知书，督促整改工程建设领域的突出问题。2、各成员单位疏理自治区工程建设领域有关制度规定，提出调整和修改完善意见，报自治区人民政府审批实施。3、查处在专项治理工作中发现的各类违纪违法案件。
第四阶段：巩固提高（2011年5月— 2011年11月）
分三个步骤：1、适时召开自治区专项治理工作经验交流座谈会，编发《工作汇编》，推广典型经验。2、自治区专项治理工作领导小组组成工作组，对全区开展工程建设领域突出问题专项治理工作进行验收，对不达标的，责令“补课”，并实施“回头看”。3、全面总结，各地、各部门、各单位于当年10月底前上报总结报告，自治区专项治理工作领导小组向自治区党委和中央纪委监察部写出专项治理工作情况报告。
四、工作要求
（一）加强领导，明确责任。要按照党委统一领导、党政齐抓共管、部门各负其责的要求，坚持“一把手负总责”和“谁主管、谁负责”，切实加强对专项治理工作的组织领导。自治区成立落实中央开展工程建设领域突出问题专项治理工作领导小组，领导小组办公室设在自治区纪委（监察厅），各成员单位和市、县（区）也要成立专项治理工作领导机构，设立办公室，明确工作职责，认真抓好专项治理工作的落实。要建立健全责任机制，落实任务分工，做到责任到位、措施到位、工作到位，对因行动缓慢、标准不高、敷衍塞责、弄虚作假等问题，造成工作失误及影响的，严格追究责任。开展专项治理中的重大情况和工作进展情况，要及时报自治区专项治理工作领导小组办公室。
（二）统筹协调，密切配合。各地、各部门、各单位要把排查问题、整改落实、加强监管、完善制度等工作有机衔接起来，协调推进。要把专项治理工作与深入学习实践科学发展观活动结合起来，与督促检查落实扩大内需、促进经济增长政策措施情况结合起来，加强日常监管，力争做到既解决当前突出问题又促进工作长远发展。要密切配合，形成合力，对工程建设领域的违法违规行为，依据有关规定从严查处，确保专项治理工作有条不紊、扎实推进。
（三）健全制度，完善机制。各地、各部门、各单位要拓宽视野，创新思路，深入把握专项治理工作的特点和规律，建立健全行政监管和建筑行业自律相结合的市场监管体制，建立工程建设领域市场运行情况的动态监测体系。要加快诚信体系建设，完善工程建设领域信誉评价、项目考核、合同履约、黑名单等市场信用记录，建立失信惩戒机制，营造“守信者荣，失信者耻”的社会氛围。
