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鼓励支持企业积极开展产学研联合。鼓励建立高新技术产学研技术创新战略联盟，对以高新技术优势领域内龙头企业为核心，联合行业内上下游企业、高等院校、科研院所建立形成的各种模式的产学研技术创新联盟，以及企业主动介入高等院校、科研院所的早期研发，建立高新技术协作与转移机制的，给予相应的奖励资助。从2009年到2012年，每年新建立产学研合作平台30个。
继续组织实施新一轮制造业信息化工程。在国家制造业信息化示范城市的基础上，进一步选择五大行业或领域，重点支持10个制造业信息化专项技术与服务平台建设，带动100个制造业信息化示范企业和信息化技术供应与服务企业，不仅推动设计研发数字化、制造装备智能化、生产过程自动化和经营管理网络化在工业企业中的普及应用，提升制造与管理水平，同时也带动本地应用软件的开发与服务的延展，促进先进制造业和现代制造服务业的发展。
（六）进一步加大自主创新环境建设
发挥高新区在地方经济发展中的积极作用。进一步推动高新区“一区多园”、高新技术特色产业基地的产业集聚和特色发展，加强高新区创新创业服务平台建设，支持区内高新技术企业积极参与和承担国家重大专项、省市重大成果转化和产业化项目的实施，发挥高新区在引领高新技术产业发展、支撑地方经济增长的集聚、辐射和带动作用，形成产业集群，促进产业结构调整和优化升级。
完善企业技术创新服务平台建设。加强高新技术产业发展公共技术服务平台建设，充分利用各类工程中心、重点实验室、大型仪器设备网等公共科技资源，整合形成面向企业开放的技术创新服务平台，帮助企业特别是中小企业开发新产品、调整产品结构、创新管理和开拓市场，对开放式、专业化共性技术研发与测试平台建设予以资助。
加强创新基础能力建设。我市企业、高等院校和科研机构联合承担国家工程实验室、国家重点实验室、国家工程（技术）研究中心建设任务，并在我市建设实施的，以及中央直属企业、国内著名企业、跨国公司、国家研究机构、国家重点大学在南京市设立独立法人资格、符合我市高新技术产业重点发展方向的研发机构的，给予配套资助与奖励。到2012年，建立国家级的实验室和各类国家级研发中心达到100家。
提升各类创新载体建设水平与速度。进一步发挥大学科技园、创新创业中心、专业孵化器和技术转移机构等创新载体，在引领高新技术产业发展、支撑我市经济增长中的集聚、孵化、辐射和带动作用，对开展创业培训、吸纳与服务自主创业成效显著的载体，以及发展建设、管理服务达到一定规模和水准的特色产业基地给予专项奖励资助。
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