四、涉及国家秘密的公文应当根据有关规定准确标注密级和保密期限，其中，“绝密”、“机密”级公文还应当标明份数序号。可以公开发布的文件应在文尾附注处加以说明。
涉密文件和个别不宜电子传输的公文、附件，可通过机要交换渠道报送或由来文单位工作人员直接送达。公文正文和附件一般应同时报送，特殊情况应事先与市政府办公厅沟通说明，附件可在正文报送后3个工作日内送达。
回复公文要坚持“明来明去”、“密来密复”的原则，严禁明密混淆、密来明复。
五、有关部门报请市政府审批的事项，凡涉及其他部门职权的，必须主动与相关部门充分协商，由主办部门主要负责人与相关部门负责人会签或联合报市政府审批。部门之间有分歧的，主办部门主要负责人要亲自协商，协商后仍不能取得一致意见的，主办部门应列明各方理据，提出办理建议，与相关部门有关负责人会签后报市政府决定。
属于主管部门职权范围内的具体问题，应当直接报送主管部门处理，不必再经市政府转办。
六、对市政府领导同志明确要求区县或部门办理并报告办理结果，及批请区县或部门负责人研究处理的批示件，区县或部门应明确专人督办，抓紧办理，及时向市政府报告情况，并附市政府领导同志批示复印件。办理情况报告应以区县或部门名义报市政府，不得直接报送市政府领导同志个人。领导同志批示多个部门的，主办部门要主动与其他部门沟通协商，并汇总办理情况，相关部门要积极配合。确因特殊原因需要较长时间反馈办理情况的，要及时以书面形式向市政府办公厅说明，定期报告办理进展情况。
对市政府领导同志批请区县或部门负责人“阅”、“参阅”、“参考”等参阅性文件，可以不单独行文回复，重要事项除外。
七、各区县、各部门需要请示市政府的事项，要给市政府留出足够的研究、决策时间，紧急公文应实事求是地标注缓急程度。自公文送达之日起，一般事项应留出不少于14个工作日的办理时间，确需14个工作日内答复的，标注为“急件”；紧急事项应留出不少于7个工作日的办理时间，确需7个工作日内答复的，标注为“特急”件；对特别紧急的事项，应注明时限要求，并事先与市政府办公厅沟通说明。通过机要交换渠道或南京市电子公务平台报送的紧急公文，要同时在信封上或平台系统内标注与公文一致的缓急程度。
