（四）做好总机构企业所得税汇算清缴工作，督促总机构按规定计算并传递分支机构的企业所得税预缴分配表。
（五）建立联系制度。定期了解总分机构生产经营情况、财务制度和会计核算办法的执行及变化情况，督促成员企业按规定报送分配表及相关财务报表等资料。
（六）组织评估检查。年度汇算清缴结束后，主管税务机关应组织纳税评估或日常检查。
第四章 特殊事项管理
第三十条 对特殊事项管理实行分项管理、后续监控的管理办法。
第三十一条 分项管理、后继监控是指对特殊事项按项目设立台账，实施“一户式”动态管理。
第三十二条 对减免税等报批类和备案类事项管理的主要内容：
（一）定期核查享受减免税等税收优惠企业的资格和条件，发现不符合优惠资格或者条件的企业，及时按规定程序取消其减免税等优惠待遇。
（二）加强企业优惠资格认定工作，与相关部门定期沟通、了解、掌握优惠资格认定情况。
（三）加强申报管理，减免税期满后，督促纳税人按期申报缴纳所得税。
（四）对享受优惠政策的企业按审批类与备案类分别设立台账，进行跟踪管理。
第三十三条 对企业所得税异常申报管理
（一）对连续三年以上亏损、长期微利微亏、零申报企业实施以下管理：
1.采集亏损企业财务数据，重点审查影响企业亏损的成本、费用以及企业资金来源、使用情况，确认纳税人亏损额，建立企业亏损及税前弥补亏损管理台账。
2.列入重点纳税评估对象，加强实地调查，了解企业生产经营情况，分析亏损原因，加强对相关项目、数据和指标的评估审核，分析其申报的真实性与合法性。
3.列入日常管理和日常检查重点。
（二）对跳跃性盈亏企业的管理。
1.税管员实地了解企业生产经营情况，掌握异常变动情况。
2.可要求企业对跳跃性盈亏年度出具企业所得税年度税务审计报告，对税务审计中发现重大问题的，税管员要加强管理，调查审核相关问题，跟踪整改情况。
