第九条 总局科教主管部门每年随部门预算时间编制下一年度汇总项目预算，按财政部、民航总局项目支出预算编制的有关要求，填写项目文本，具体包括：项目申请书、项目可行性报告、评审报告和各项目的明细费用预算，并按项目轻重缓急，择优遴选后进行排序，分单位逐项列明。经总局财务主管部门、总局办公厅会签后，报主管科教和财务工作的局领导审核，并报总局局长审批。批准后列入总局部门预算，严格按预算执行。
第十条 为减轻项目管理成本，提高工作效率，对行业影响较大的科教项目（预算金额50万元以上），按第九条执行。对低于限额的项目，原则上执行第九条，可以打包组合方式实施。
第十一条 科教资金预算由总局财务主管部门下达。
第十二条 预算执行过程中，由总局项目主管司局根据批准的项目预算及进展情况，提出用款申请，总局财务主管部门审核无误后拨款。其中，属于总局独立完成项目，资金拨付总局办公厅，由其管理使用。
第十三条 对年度预算以外的新增支出项目，原则上不予批准；确属工作需要的，由总局科教主管部门提出预算方案，经总局财务主管部门审核后，报总局领导审批。审批程序与年度预算一致。追加预算金额不超过科教资金结余。
第十四条 项目经费专款专用，不得截留、挪用或挤占。开支范围严格限于项目规定的内容。
第十五条 重大项目须经专家组评审，项目经费一次核定，数额较大的按进展程度分期拨付，年终如有结余，可结转下年继续使用。
第十六条 项目执行中，项目承担部门应按照总局科教主管部门下达的项目用途使用资金，按照国家有关财务会计制度单独核算、专款专用，自觉接受总局有关部门的监督检查。如有违反法律法规、财经纪律及不按规定使用科教资金等行为的，应承担相应责任。
第十七条 年度终了，总局科教主管部门负责提出年度预算执行情况报告，会签总局财务主管部门后，报总局领导。
第四章 监督检查
第十八条 科教资金的管理使用由项目主管司局和项目承担单位共同负责，接受总局财务主管部门、科教主管部门和纪检监察部门的监督检查。
