（二）政策法规司
　　研究制订发展煤炭行业的方针、政策和法规；组织起草重要报告、综合性文件；归口管理行业法规、规范和煤炭经济体制改革；指导行业思想政治工作。
　　（三）规划发展司
　　组织研究煤炭行业发展战略，编制煤炭行业发展和煤炭资源利用规划及年度生产、基建、引进计划；综合平衡、协调与其他行业的配合协作；制定煤炭工业基本建设、经济技术政策、规程、规范和标准；负责重大建设项目的立项审查和新矿区建设、老矿区总体发展规划审查。
　　（四）生产协调司
　　制订煤炭生产技术政策、规程和标准；协调煤炭企业内外部关系；指导、协调地方煤矿的整顿、扶持、改造、联合、提高；指导煤矿质量标准化和现代化矿井建设；负责限额以上生产矿井、洗煤厂改扩建和技改项目的立项审查；规划、协调行业环保工作。
　　（五）煤炭调运司
　　在国家宏观计划指导下，编制煤炭调运计划，协调产、运、需关系，掌握和研究煤炭运销和市场信息，培育和发展煤炭市场，推进煤炭运销体制改革。
　　（六）安全司
　　制订煤炭行业的安全规程；监督安全法规的贯彻执行；协调重大伤亡事故的救护及调查；组织安全培训。
　　（七）财务劳资司
　　协同有关部门运用经济杠杆和工资政策调控煤炭企业发展生产，提高经济效益。对大型骨干煤炭企业国有资产的保值增殖实行监督、检查和评价，负责管理部直属事业单位国有资产；制订企业工效挂钩办法，对工资总额进行宏观管理；推进煤炭行业职工养老保险、医疗保险、工伤保险制度和住房制度改革。审查汇编部属企事业单位年度财务决算。
　　（八）人事司
　　制订煤炭工业人事管理的方针、政策和规章制度；编制煤炭工业人才规划及干部年度需求计划；管理部机关及部属事业单位人事工作。
　　（九）科技教育司
　　制订煤炭工业科技教育发展方针、政策和规划，以及重大技术法规、标准、规范；组织重大技术攻关，归口管理重大新技术、新工艺、新产品的鉴定、推广，以及专利和技术监督工作。审定院校发展规划，编制年度院校招生计划；归口管理教育行政工作，推进直属高校改革。
　　（十）综合利用多种经营司
　　研究制订煤炭资源合理开发、综合利用的方针、政策；协同有关部门编制煤炭行业产业结构、产品结构调整和资源综合利用规划；协调、指导企业发展资源综合利用、多种经营和第三产业；协调安排发展三产的贷款和资源综合利用、煤炭深加工及节能专项资金。

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