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注：管辖海域栏的比例数为自然保护区占我国管辖海域面积（﹪ ）
1、东北山地平原区。本区是自然资源丰富的地区，森林主要分布于大、小兴安岭、长白山等地，是我国现存最大的原始林区，森林面积约占全国的1/4。草原主要分布于大兴安岭以西地区，尤以呼伦贝尔草原为我国仅有的两大个片高草草原之一。小兴安岭东南侧和长白山北端的三江平原是湿地分布比较集中的地区。规划到2000年，全区自然保护区总数达160－170个，面积达640－665万公顷，占全区土地面积的5.4－5.6﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积的7﹪以上。
2、蒙新高原荒漠区。本区是八个陆地自然区域中面积最大的一个区，区内地貌类型复杂，气候干燥，地表植被稀疏而单纯，生态系统脆弱，对人为干扰非常敏感，一旦破坏很难恢复。本区矿产资源丰富，又是未来国家开发和建设的重点，应抢救性地建立一批自然保护区。规划到2000年，自然保护区总数达75－85个，面积达2255－2385万公顷，占全国土地面积的8.4－8.9﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积12﹪以上。
3、华北平原黄土高原区。本区是我国开发最早的地区之一，长期垦殖和其他生产活动的影响使自然景观发生了很大变化，原生植被已不复存在，但一些次生植被加以保护，促其恢复对保护生态环境很有意义。西部的黄土高原，由于植被的破坏已成为水土流失最严重的地区。规划到2000年，全区自然保护区总数达100－110个，面积达95－110万公顷，占土地面积的1.4－1.6﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积2﹪以上。
4、青藏高原寒漠区。本区自然条件非常独特，高原自然景观保存比较完整，高寒类型的野生动物资源丰富且极具代表性。人口稀少，开发强度低，适宜建立大面积的自然保护区。规划到2000年，全区自然保护区总数达32－37个，面积4290－4310万公顷，占土地面积24.8－24.9﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积26﹪以上。
5、西南高山峡谷区。本区是世界上高山植物区系最丰富的区域，古老和孑遗植物种类很多。同时，本区曾是第四纪冰川期动物的避难所，珍稀动物种类较多，邛崃山、凉山、岷山等地则是大熊猫的主要分布地，本区是我国自然保护区建设的重点地区。规划到2000年，全区自然保护区总数达65－75个，面积达330－370万公顷，占土地面积5.1－5.7﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积7﹪以上。
6、中南西部山地丘陵区。本区动、植物区系组成比较复杂，珍稀濒危物种较多。同时本区也是重要的粮、油作物产区。由于长期毁林开荒，森林覆盖率低，水土流失严重，野生动植物种类减少，不少物种濒于灭绝。规划到2000年，全区自然保护区总数达175－185个，面积达280－295万公顷，占土地面积3－3.2﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积4﹪以上。
7、华东丘陵平原区。本区是人口最密集、工农业最发达的地区。由于长期开发，除少数山区外，原生植被残存较少。从抢救保护该地区残存的自然生态系统和野生动植物出发，规划到2000年，全区自然保护区总数达215－235个，面积达220－235万公顷，占土地面积2.6－2.8﹪；到2010年，自然保护区面积占土地面积3.5﹪以上。
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