加大环境友好型农业生产技术的研发推广力度，制定、完善并监督实施农药、化肥、农膜等农业生产资料的环境安全使用标准及生产操作技术规范，指导农民科学使用农用化学品，制定支持有机肥生产和使用的政策。禁止秸秆焚烧，推进秸秆的综合利用，大力推广秸秆还田、气化、制造轻质建材等综合利用。
加强对农产品生产基地和生产加工企业周边地区的环境监测、环境质量评价和监管工作。推动全国农业生产方式和结构的转型，扩大生态农业生产面积，特别是在条件适宜的地区，积极发展绿色和有机食品生产，完善、制定相关监测标准及技术规范。继续深入开展国家级有机食品生产基地建设工作，制定详细的环境管理计划，开展生产基地水体、土壤、大气环境质量定期监测，综合防治病虫害。“十一五”期间，优先在西部、中部地区自然条件良好的农村地区建设一批有机食品生产基地，东部地区则考虑选取有机食品发展较快、基础较好的一些地区建设示范工程。
4、防治畜禽和水产养殖污染
根据《
畜禽养殖污染防治管理办法》，划定畜禽禁养区，加强畜禽养殖污染防治和环境执法。禁养区内不得新建任何畜禽养殖场，已建的畜禽养殖场要限期搬迁或关闭。制定、完善畜禽养殖环境保护相关标准和技术规范，研究并制定促进畜禽养殖废弃物综合利用及产业化的经济技术政策、发展规划。积极发展养殖小区，推广健康养殖技术，实行种养结合、雨污分流、清洁生产、干湿分离，实现畜禽粪便资源化利用，加快推进规模化畜禽养殖场的技术改进与污染治理。
优先在重点流域、区域和畜禽养殖环境问题较为严重的地区，根据当地经济发展水平、种植业和养殖业布局等具体情况，选择生产沼气、堆肥等方法建设畜禽养殖污染防治示范工程，总结推广一批经济适用的畜禽养殖污染防治和废弃物综合利用技术和模式，加大推广力度，切实推动畜禽养殖环境问题的解决。
开展水产养殖污染防治工作。对水产养殖环境问题进行调查研究，制定水产养殖环境保护法规、技术规范，推动水产养殖环境监管工作法制化、规范化。
（四）巩固推进生态示范创建工作
大力推进生态省（市、县）、环境优美乡镇和生态村的建设，进一步完善生态省（市、县）考核的有关指标体系，制定相关管理和考核验收办法。以生态示范创建为载体，推动区域经济、社会和资源、环境的协调发展，减少资源消耗和环境污染，全面提高人们的生产与生活环境质量。
1、深化生态省、生态市和生态县建设
根据各地自然条件、社会经济基础，分类指导，分区推进，因地制宜开展生态示范创建工作。在稳定东部地区创建成果的同时，鼓励经济发展条件较好并位于重要生态功能区域的市、县开展生态市、生态县的建设。加强对中西部地区的宣传和培训，加大中西部地区创建工作的推进力度，稳步扩大生态省（市、县）建设的覆盖面。
2、积极推进环境优美乡镇创建工作
进一步推动环境优美乡镇创建工作。按照自下而上的思路，根据生态创建工作“两个80％”（即生态市所辖80％的县要达到生态县的标准，生态县所辖80％的乡镇要达到环境优美乡镇的标准）的基本要求，把创建工作与生态县建设和农村经济社会发展有机结合起来，鼓励和引导具有较好社会基础、较强经济实力、较优环境条件的乡镇率先开展环境优美乡镇创建工作。
3、大力开展生态村建设
结合《农村小康环保行动计划》实施，制订“国家级生态村”考核验收标准，指导并推动各地因地制宜地开展生态村创建活动，并以此作为生态示范创建的细胞工程，开展村庄环境综合整治，发展生态经济，提高村庄生态文明水平，全面改善农村环境与整体面貌。“十一五”期间，力争创建8000个生态村，推动全国农村环境保护水平整体提升。
