《办法》第二条第（五）、第（六）项规定了定期停刊、停业整顿两种行政处罚。
定期停刊，是指停止某一期期刊的出版。
停业整顿，是指定期停止期刊社（编辑部）所有与出版活动有关的业务，并进行整顿。即停止期刊社（编辑部）的编辑、印刷、发行工作，并对以上三个部门进行整顿。
一个期刊在两年内，因违反《办法》而被处以两次定期停刊的，第二次即应加重处罚，按照《办法》第二条第（六）项停业整顿处罚。时间以处罚决定之日起开始计算。
停业整顿所讲的定期，是指该种行政处罚应在１个月以上６个月以下。一个期刊在两年内，因违反《办法》而被处以两次停业整顿的，第二次即应加重处罚，按照《办法》第二条第（七）项撤销登记处罚。时间以处罚决定之日起开始计算。
二、停止出售，没收或销毁违法期刊在报署核准期间，对违法期刊如何处置？
《办法》第二条第（四）项规定的停止出售，没收或销毁违法期刊，根据《期刊管理暂行规定》第三十七条的规定，给予该项处罚，须报新闻出版署核准。但是，在核准期间如不对违法期刊采取一定的措施，该项处罚在核准后就会落空。为了能够有效地执行该项处罚，省、自治区、直辖市和计划单列市的新闻出版局对该项规定的处罚，在报署核准期间，可先行采取封存违法期刊的临时措施，待署核准后，再根据核准的具体内容予以执行。
三、怎样认定期刊出租、出卖其合法凭证？
《办法》第十八条第二款规定的期刊出租、出卖其合法出版凭证，即是一般讲的卖刊号或变相卖刊号，它是指期刊社将出版权（组稿、编稿、终审发稿、印刷和广告宣传等）或部分出版权委托给本刊社以外的人或单位，并向被委托方收取一定费用；或者期刊社名义上享有出版权，但是，期刊社不直接派人结算印刷费用，而由本刊社以外的人或单位代办，并同时委托其代办发行及广告宣传等，期刊社因此向被委托方收取一定的费用。卖刊号或变相卖刊号依照《办法》第十八条第二款的规定处罚。
四、怎样认定用刊号出版图书？
《办法》第十九条讲的期刊用刊号出版图书，是指期刊社以刊号出版在内容上只有一个中心点，不设置栏目，在封面上以要目代替刊号，没有卷、期或年、月顺序编号的所谓期刊。
五、如何运用《办法》第二十二条的规定？
