六、对重大复杂案件的调查，可由人民检察院、公安机关和食品卫生监督机构共同组成调查组，共同进行现场勘验、检查、提出对事故直接责任人的处理意见。
七、及时依法做好取证工作。事故调查组或食品卫生监督机构认为必要时，可组织专家对事故进行技术鉴定。
八、食品卫生监督机构在查处行政案件中，发现触犯刑律的案件，应当按照案件管辖，及时向公安机关或人民检察院移送。
九、在食品卫生监督工作中，对属于兽医卫生监督范围的病畜肉判定有疑问时，经畜牧兽医部门重新鉴定后，如属于违反食品卫生法的刑事案件，由食品卫生监督机构按照案件管辖，移送公安机关或人民检察院。
十、受理案件机关在认定案件的性质和直接责任人员上，如与有关方面存在重大分歧，遇有困难和阻力时，应分别向各自的上级领导机关反映。
十一、人民检察院依法对被告人作出免予起诉决定后，应将《免予起诉决定书》交给被告人所在单位，同时提出给被告人行政处理的建议。
十二、对违反食品卫生法需要追究刑事责任的案件，任何机关、单位都不能以党纪处理或行政处理代替刑事处罚。
十三、对违反食品卫生法造成严重后果的案件，发案单位如隐瞒不报，虚报或拖延不报，食品卫生监督机构、公安机关、人民检察院，应建议有关单位对责任人员给予纪律处分或经济制裁；情节、后果严重，触犯刑律的，由司法机关追究其刑事责任。
十四、对于违反食品卫生法的典型案例，应当公开处理，采取各种形式和方法，加强法制宣传，教育公民遵章守法。食品卫生监督机构，应加强执法监督工作，对于食品生产和经营单位存在的事故隐患提出改进建议，以预防危害事故的发生。
十五、上级食品卫生行政主管部门、公安机关、人民检察院，应密切配合，及时交流情况。对来自下一级的遇有困难和阻力的案件，要及时互相研究，统一认识，采取措施，促进解决。
