1.按照规定的程序和标准，严格审批企业所得税减免税、财产损失税前扣除、总机构提取管理费税前扣除、集中提取技术开发费税前扣除，并对取消审批的项目做好核实和资料备案工作。
2.加强企业投资、合并、分立、关联交易等涉税事项管理，分析判断适用税收政策是否准确，资产计税成本确定是否正确，有无故意避税行为。
3.分户建立台账，记录其生产经营、财务核算、税款缴纳、减免税、亏损或弥补亏损、广告费结转、工资结余（工效挂钩企业）、企业改组改制资产计税成本、固定资产折旧、技术改造项目国产设备投资抵免等信息。
（三）汇算清缴。加强企业所得税政策和征管的宣传辅导，重点是当年新出台的企业所得税政策、汇算清缴程序、要求和法律责任。加强纳税申报后的逻辑审核和信息比对工作，纳税申报表中的收入项目、扣除项目要与企业流转税申报表中的有关项目和财务会计报表的销售（营业）收入、投资收入、营业外收入、其他收入进行比对。扣除和减免税项目要与研发费用扣除、减免税、亏损弥补、国产设备投资抵免与日常管理台账数据进行分析比对。利用“一户式”存储信息和日常管理信息，分析固定资产折旧、无形资产摊销、“三项”费用等纳税调整的准确性。
（四）纳税评估。主管税务机关应对企业所得税重点纳税人每年进行分户纳税评估。即企业所得税汇算清缴结束后，根据重点纳税人年度纳税申报资料和财务会计报表、涉税审核审批资料、行业信息以及日常管理掌握的征管信息，对重点纳税人逐户进行企业所得税纳税评估，并对纳税评估结果及时进行处理。
（五）税源分析和预测。要充分依托信息化手段，综合运用对比分析法、相关分析法、结构分析法等方法，对每户重点纳税人从收入额、应纳税所得额、应纳所得税额等项目的总量、增幅、增量、增量贡献率等方面进行纵向和横向分析。凡有关项目同期增减变化额度或者幅度较大的，应及时深入企业了解变化原因，从经济变动、税收政策、征管状况等方面分析对收入变化的影响，并及时采取有针对性的措施。
五、一般查账征收纳税人的管理
对企业所得税一般查账征收的纳税人，在管理上，应坚持以管事为主，以行业管理为重点，以纳税评估为手段，强化税源监控。
（一）涉税事项的管理。
1.做好审批和备案管理。重点抓好企业所得税减免税、财产损失、管理费、技术开发费、国产设备投资抵免等审批事项的调查核实、审批审核工作，加强取消审批项目的资料备案工作和后续管理工作。
2.分户建立台账。根据管理的实际需要，明确纳税申报时需报送的相关信息，对弥补亏损、减免税、工资结余（工效挂钩企业）、企业改组改制资产计税成本、固定资产折旧、广告费、技术改造项目国产设备投资抵免等具有时间延续性的税前扣除项目，实行台账管理。
