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1.完善粮食科技协调管理体系。全面指导行业科技发展方向，统筹、协调、管理行业科技资源，通过组织实施重大科技项目，推进粮食科学技术进步和技术创新。各级粮食行政主管部门通过管理协调，组织和引导社会科技资源向粮食行业配置，营造上下结合的政策环境。
2.建设以龙头企业和科技型企业为主体，产学研互动的技术创新体系。粮食龙头企业在粮食经济和产业发展中的重要作用，决定了其在粮食科技创新体系中的主体地位。“十一五”重点突出建立以企业为主体、产学研互动的机制，在企业形成吸引人才、创新技术的研发平台，不断培育企业竞争的后发优势。通过增强企业自身的人才集聚和研发能力，使企业成为创新人才和资金的主要投入者、科技成果转化的主体、新技术的创造者和产业发展先导技术的引领者。
转制科研院所是粮食行业科技创新体系的优良资源，是行业应用技术研发的主体力量。发挥以转制科研院所和大型粮食科技型企业为主体，市场经济为导向，建立粮食行业产学研相结合的创新机制，实现创新主体与经营主体最紧密的结合。促进企业与科研单位和高校之间的知识流动和技术转让。在以高新技术为先导，转变企业经济增长方式的同时，不断提高企业高技术产品的市场竞争能力和抗风险能力。
3.建设以公益科研机构和大学为主的科研创新体系。发挥社会公益科研机构和大学新科学创造和引领技术持续创新的作用。通过建立稳定的投入和激励机制，形成优良的科研环境，突出以人为本，把社会公益科研机构和大学建成粮食学科带头人才的主要培养基地，不断提高粮食科技的原始创新能力。吸引国内外高层研究人才，为粮食科学发展贡献聪明才智。
4.建设以地方粮食科研院所为主的区域科研创新体系。进一步突出省级粮食科研院所学科优势和服务特色。各级粮食科研机构、质量检测机构要加强对地区粮食经济和农村粮食产后的技术服务。联合农村技术推广体系，建立国家与区域农村粮食产后技术服务中心。不断推广先进、适用的粮食新技术，改变农村传统落后的粮食流通技术方式。通过成果转化和高技术产业化，为区域经济发展和产业结构调整，粮食主产区产业化，培育新的经济增长点给予技术支撑。通过加强国家与地方，以及地区间、部门（行业）间的科研人员交流和技术项目合作，发展和强化技术优势，不断提高市场竞争力。
5.建设中介机构有效参与的科技服务体系。“十一五”通过加强中介组织的社会化网络服务体系建设，发挥各级粮食行业协会、粮油学会联系各创新主体的桥梁纽带作用，为粮食科技发展，为企业技术创新不断提供信息指导和市场服务。加强与政府管理部门的沟通，通过网络化服务推广技术成果，使之成为创新体系的重要组成部分。
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