专项整治工作总体上分四个阶段进行。
第一阶段：3-4月上旬，研究制定专项整治方案，部署有关工作。各有关行业行政主管部门根据本行业（或部门）建筑施工安全的特点，研究制定具体的专项整治方案，并部署实施。
第二阶段：4月中旬-9月份，具体实施。各有关行业行政主管部门将专项整治方案及有关要求贯彻落实到建设工程各有关责任主体单位和地方有关部门，开展自查和整改。各有关行业行政主管部门应加强分类指导、监督和检查。
第三阶段：10月份，组织督查和抽查。对重点地区、重点企业、重点项目进行抽查和督查，发现存在突出问题和重大隐患的，要责令认真整改，并严肃处理。
第四阶段：11-12月份，总结评估。各有关部门对已开展的工作进行分析、研究，全面总结，形成阶段性成果。同时，研究进一步深化完善的意见等。
六、工作要求
（一）加强领导，落实责任
各有关行业行政主管部门应成立本行业（或部门）建筑施工安全专项整治工作领导小组，切实加强组织领导，落实责任，精心组织，周密部署。领导小组要定期汇总分析、研究解决有关情况和问题，并于每季未将有关情况和年未将专项整治工作评估情况及总结报告抄送国务院安全生产委员会办公室。
（二）突出重点，务求实效
各有关行业行政主管部门要依据本行业建设工程的特点，抓住主要问题和薄弱环节，制定有针对性的，且切实可行的，操作性强的实施方案和细则，明确具体要求，以点带面，整体推进。同时，专项整治工作还应与部门安全监督管理工作，与企业日常施工现场安全管理工作有机结合起来，不搞花架子，不做表面文章，切实把专项整治工作抓好、做细、做实，力争年内取得阶段性成效。
（三）强化监督，严格督查
为确保专项整治工作的进度和质量，各有关行业行政主管部门要适时对重点地区、重点企业和重点工程项目进行监督检查，及时发现问题，限期整改，消除事故隐患。要总结工作经验，稳步推进整治。在专项整治期间，对整治工作不认真，走过场，工作不实的，要严肃批评，并予以通报，责令整改。列入专项整治重点对象仍发生重、特大伤亡事故的，要依法从重从严查处有关责任人和责任单位，并追究有关行政领导的责任。
（四）加强沟通，做好宣传
