（1）在每条河流的回水区中段和回水区上游（未入回水区）各布设1个监测断面（重庆忠县玉溪河因河段较短，仅在其回水区中段布设1个断面；万州区苎溪河污染源较多，在其回水区中段布设2个断面），共62个监测断面。
（2）在坝前回水区木鱼岛库湾布设1个监测断面。
三、监测指标
（1）“水华”预警监测项目：共19项，分别为pH、溶解氧（DO）、化学需氧量（CODCr）、高锰酸盐指数（CODMn）、氨氮（NH4-N）、总氮（TN）、总磷（TP）、石油类（OIL）、五日生化需氧量（BOD5）、汞（Hg）、铅（Pb）、挥发酚、叶绿素a（Chla）、透明度（SD）、悬浮物、电导率、水温、流量、流速。
（2）“水华”应急监测项目：共11项，分别为水温、流量、流速、溶解氧、叶绿素a、透明度、高锰酸盐指数、总氮、总磷、化学需氧量、优势藻类。
（3）“水华”应急描述项目：水色、气味、水面漂浮物情况、“水华”范围（河长、河宽）等。
（4）地理位置：开展“水华”预警监测和应急监测时，记录监测断面所在地理位置（经度、纬度）。
四、监测时间和频次
（1）“水华”预警监测：2006年4月-10月，每月监测一次，监测时间为1日-10日。此外，各有关监测站每月须对回水区至少开展三次定期巡查（上、中、下旬各一次），并填写“水华”预警巡查记录表（附表2）。
（2）“水华”应急监测：在巡查中或通过其它渠道得知“水华”出现，必须立即展开应急监测工作，做好现场采样和实验室测试分析，同时填写“水华”应急监测记录表（附表3）。
五、监测方法和评价标准
“水华”预警和应急监测断面采样要求按照《地表水和污水监测技术规范》进行。水质评价和水体营养状况评价分别执行《
地表水环境质量标准（GB3838-2002）》和中国环境监测总站制定的《湖泊水库富营养化评价方法及分级技术规定》（总站生函090号）。
六、报告和数据报送要求
（一）报送内容和报送时间
“水华”预警监测期间，重庆市环境监测中心负责收集汇总重庆库区所有23条河流46个断面的监测数据，并形成监测评价报告；湖北省宜昌市环境监测站负责收集汇总湖北库区夷陵区、秭归县、兴山县7条河流和木鱼岛库湾1个断面共15个断面的监测数据，并形成监测评价报告；湖北省巴东县站对巴东县2个断面的监测数据进行分析汇总并形成监测评价报告。上述3个监测站于每月20日前将监测数据和监测评价报告报送中国环境监测总站，同时负责收集汇总预警巡查报告，随时报送。总站于每月月底前完成“水华”预警和应急监测报告，报送国家环境保护总局。
