国税机关对一般纳税人的审核，主要有以下几方面：
(一)能否按规定领购、开具和保管专用发票；
(二)有无专职或兼职并持有会计证的会计人员；
(三)能否按财务会计制度规定、设置总帐和有关明细帐进行会计核算，真实反映企业生产、经营状况；
(四)能否准确核算增值税销项税金、进项税金和应交税金；
(五)能否按规定向主管国税机关准确提供税务资料；
(六)能否按规定如实填报增值税纳税申报表，并按期纳税。
经过审核，发现纳税人有下列情况之一的，应按规定进行处理：
1、审核中发现一般纳税人违反专用发票使用规定的，应依据《税收征管法》、《
增值税专用发票使用规定》及其相关的规定进行处罚。经市、县国税机关批准，在6个月内停止其使用专用发票，收缴结存的专用发票，暂扣专用发票领购簿，并责令纳税人限期完善专用发票的保管使用制度。对逾期仍达不到要求，经市、县国税机关批准，可取消其一般纳税人资格。
2、审核中发现一般纳税人年应税销售额在规定标准以上的，但不具备规定条件的，经市、县国税机关批准，停止其抵扣进项税额，按销售额依规定税率计算征收应纳税款，同时取消其专用发票使用权，并收缴结存的专用发票和专用发票领购簿。待纳税人完善有关制度，符合一般纳税人条件后，经市、县国税局批准，方可使用专用发票，允许抵扣进项税额。但停止抵扣期间购进货物、应税劳务的进项税额，以及按规定可抵扣的期初存货已征税款，不得结转到经批准准许抵扣进项税额时抵扣。
3、核审中发现一般纳税人年应税销售额在规定标准以下的，不具备有关条件的，经市、县国税机关批准，可停止其抵扣进项税金，按销售额依规定税率计算应纳税金，并取消其专用发票使用权，收缴结存的专用发票和专用发票领购簿，责令其3个月内健全完善有关制度。对3个月后经验收仍达不到国税机关要求的，经市、县国税机关批准，取消其一般纳税人资格，按小规模纳税人的征税规定征税。停止抵扣期间购进货物、应税劳务的进项税金，以及按规定可抵扣的期初存货已征税款不得结转到经批准允许抵扣进项税金时抵扣。
4、审核中发现一般纳税人不能按规定如实填报增值税纳税申报表、附表、提供有关资料，并且不能按期申报纳税的，除应按《税收征管法》有关规定予以处罚外，经市、县国税机关批准，还可停供专用发票。
