(二)第二期工程：2006-2010年
在继续完善全国中小学生课外文体活动组织体系的基础上，充分发挥各省、自治区、直辖市“示范区”的带头作用，继续扩大规模，提高工作水平，使在校中小学生经常参加文体活动总数达到85%左右，人数达到1.8亿。
二、实施工作的原则
教育性、科学性、趣味性原则。课外文体活动要坚持育人的宗旨，遵循教育规律和中小学生身心发展特点，寓学于乐，寓炼于乐，切忌成人化和强制性。
全面性原则。课外文体活动的内容与形式要丰富多彩，能够满足不同特长、不同兴趣、不同层次学生的发展需要，促进中小学生的身体素质、心理素质和审美素质的全面提高，并形成在普及与提高的基础上良性发展的局面。
坚持自主自愿与积极引导相结合原则。在组织学生参加课外文体活动的过程中，教师的鼓励、引导是必要的，同时要充分尊重学生的自我选择权和自主活动权，在组织活动时要为学生营造一个自主讨论、组织、操作、交流和评价的良好环境和氛围。
坚持校内校外相结合原则。应以校内教育为主阵地，充分发挥校外教育的独特功能，促进校内校外教育的有机结合，密切配合家庭教育和社区教育，努力创建良好的课外教育环境。
坚持安全第一原则。在课外文体活动的组织与实施过程中，要加强安全教育，要制定出安全措施、应急措施和防范措施，避免和防止意外事故的发生。但也要防止以怕出事故为由不积极开展活动的倾向。
三、实施工作的方法
在组织方面，各级教育、体育、共青团、少工委等部门要密切配合，齐抓共管，共同做好中小学生课外文体活动的组织、协调工作。
九年义务教育阶段的在校学生，要利用每天下午课后时间，开展不少于一小时的文体活动或其他课外活动，活动内容要贴近学生生活，活动形式可采取兴趣小组或班级之间、年级之间、校际之间的各种比赛活动等。
充分利用校园和校外的少年宫、青少年文体活动中心、文体俱乐部及少体校等现有文体设施和师资力量，建立稳定的专项课外文体活动训练点，定期组织各种形式与规模的文体竞赛、夏令营、冬令营等活动，推动中小学生课外文体活动形成规模、提高水平。
建立评比表彰制度，促进“全国中小学生课外文体活动工程”全面持久地在全国开展。教育部、国家体育总局、共青团中央、全国少工委将从2001年开始，对各地“全国中小学生课外文体活动工程”的开展情况定期组织检查评估，对开展活动有突出成效的地(市、区)，县(市)授予“全国中小学生课外文体活动工程示范区”称号并予以表彰。
