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4．防病治病形势依然严峻。近年来，我国鼠疫、霍乱呈活跃之势，不仅给人民健康带来很大威胁，也使防治工作更加困难；一些曾经得到较好控制或者相对稳定的疾病，如性病、结核病、血吸虫病等又重新抬头，且有蔓延之势；由于卖淫、嫖娼、吸毒活动的增长，我国面临着艾滋病大面积流行的潜在威胁；病毒性肝炎等疾病发病人数多，危害严重，已成为近年来法定报告传染病的主要病种；与环境、营养等因素密切相关的疾病，如地氟病、地甲病、大骨节病等仍未得到有效控制；慢性非传染病已成为居民常见病、多发病，精神疾病患病率持续增加；各种由职业危害所致的急、慢性职业病居高不下，已成为影响广大劳动者健康的主要卫生问题。上述情况表明，我国疾病控制工作面临比以往更严峻的形势，承担着两次卫生革命的双重任务，迫切需要调整预防战略和改革疾病控制工作体系。
5．城镇化进程加快，对卫生机构应付现代公共卫生问题的能力带来挑战；社会主义市场经济体制的建立，对公共卫生监督职能提出了更高要求。“十五”期间，我国政府将通过实行大中小城市和小城镇协调发展的战略，大力推进城镇化进程。伴随城镇化进程的加快，将带来空气、水源、噪声、化学性污染等环境、生态问题，以及城市人口密度过高、住房和交通拥挤、生活空间缩小、工作竞争压力加剧等社会问题。这些将成为影响劳动者健康以及家庭和社会稳定的新卫生问题。这些变化迫切要求卫生机构实现从单一生物医学模式向生物—心理—社会医学模式转变，从对个体防治疾病方式向综合防治和群体干预方式转变，同时要特别重视对环境和人的行为危险因素的控制和干预工作。
随着社会主义市场经济体制的建立和不断完善，需要政府针对不断出现的新情况、新问题，研究制定相应的卫生法规、政策，依法规范社会公共卫生秩序；同时，随着食品等健康相关产品生产贸易的不断扩大，各种新技术、新材料的广泛应用和核能事业的发展，也对卫生监督执法带来新的挑战，要求进一步提高执法水平，同时尽快改善执法技术手段和检测、技术仲裁等技术支撑系统。
6．西部大开发将为西部地区卫生发展带来机遇和挑战。实施西部大开发战略，客观上要求卫生部门必须首先做好医疗、预防保健工作，为西部经济建设营造好的投资环境，提供强有力的健康保障；同时，西部大开发战略中提出的加快基础设施建设、加强生态环境保护和建设、调整产业结构、发展科技教育和文化卫生事业等措施，也为发展西部卫生事业，防治当地重点传染病与地方病，加快卫生基础设施建设和卫生人力开发等工作带来历史性机遇。为此，卫生部门应树立机遇意识和主动参与意识，积极采取相关措施，将西部卫生事业发展纳入西部大开发总体规划，在为实施西部大开发战略作出贡献的同时，促使西部卫生工作全面跃上一个新台阶。
7．科技体制改革与发展带来机遇与挑战。21世纪是信息化、网络化时代，网上医疗服务咨询、购药成为可能。同时远程医疗、远程教育也将得到进一步发展，越来越多的高科技医用设备、药物、基因技术将广泛应用。这一方面使群众看病更加方便，一些疾病能得到早期诊断、早期筛查，提高治疗和预防效果；另一方面，新技术、新药物的昂贵价格也会导致医疗成本不断增加和医疗费用的迅速上涨。因此，迫切需要卫生部门尽快研究制定既能推进医学技术发展，又能有效控制费用的新技术准入制度及相应管理办法。
为适应全面推进科研机构管理体制改革的要求，卫生科研机构的转制进程将大大加快。如何根据国家战略性、长远性、基础性、重大公益性研究的需求，按照多种形式构建卫生科技创新体系迫在眉睫。
8．中国加入WTO的可能影响。我国即将加入WTO。“入世”对卫生行业发展将带来机遇和挑战。首先，医疗领域将在更大程度上开放，竞争加剧将促进国内医疗机构的改组与改制，提高医疗服务质量和管理水平；其次，由于人们崇尚自然，新的化学药物开发难度加大，以及一些化学药物存在的毒副作用等不利因素，使天然药物成为创制新药的重要研究对象，中医药发展将具有良好的市场前景；第三，食品贸易在我国对外贸易中占有相当份额，食品安全是影响食品贸易的重要因素。但目前我国食品卫生标准体系与WTO规定的食品贸易争端的裁决依据——国际食品法典有较大差距，急需尽快完善。因此，卫生及相关部门应尽快熟悉有关规则，做好政策衔接，提高在医疗服务准入条件、医疗质量与安全、医疗事故鉴定与纠纷裁决等方面的监管能力及执法公正性。同时，卫生部门要充分利用WTO保护发展中国家的优惠待遇和例外条款，结合卫生行业特点，积极配合有关部门，参与市场经济秩序规范和服务行业规则的制订。
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