第十六条 国家文物局会同财政部对立项申请进行评估。评估标准为：
（一）遗址须符合大遗址的界定；
（二）抢救保护工作急迫；
（三）地方政府拟对项目采取保护措施并落实相应配套经费；
（四）实施保护措施后具有良好的保护和展示效果。
第十七条 通过评估的项目列入备选项目库，并在国家文物局网站上公布，同时向省级文物部门下达编制项目工程设计方案和预算的通知书，抄送省级财政部门和项目立项申请单位（以下简称“项目单位”）。
第十八条 入选备选项目库的项目工程设计方案（以下简称“方案”）和预算编制工作由项目立项申请单位负责，委托具有资质的设计单位制定实施方案和预算。方案涉及当地土地利用、城市规划、环境保护、安全、产业发展规划等事宜的，报送前要获得相关部门批准。
第十九条 省级文物行政主管部门组织对项目方案和预算进行初步评审，涉及地方配套的项目，应征求省级财政部门的意见。通过初步评审的方案和预算由省级文物主管部门报送国家文物局。
国家文物局组织对项目方案和预算申请数进行审核，通过评审的项目，经商财政部同意后纳入实施项目库。
第二十条 实施项目库由财政部和国家文物局统一规划、共同建设，并按照下列原则共同管理：
（一）依据国家有关政策、方针和项目的轻重缓急，对入库项目进行合理排序。
（二）项目入库后，原则上不再调整，因特殊情况确需调整的，按照原审批程序重新报批。
（三）上年延续项目和当年预算未安排项目滚动进入下一年度实施项目库。
第五章 经费的申请与管理
第二十一条 专项经费每年申请一次，申请经费的项目分为新增项目和延续项目。新增项目是指本年度新增的需要列入预算的项目，延续项目是指往年批准的、需要在本年度预算中继续安排经费的项目。非实施项目库中的项目原则上不予以安排。
经费申请截止时间为上一年度10月31日。
第二十二条 经费申请单位为省级文物行政主管部门和财政部门。申请单位须按照《大遗址保护专项经费项目经费申请书》（附2）的具体要求填写申请书，经省级文物主管部门、财政部门审核后联署向财政部和国家文物局申请专项经费。凡越级上报或单方面上报的申请均不予受理。
第二十三条 财政部根据年度财力状况、实施项目库排序和国家文物局所拟项目及经费安排计划，对申请专项经费的项目进行排查、审核后，确定补助数额并予以批复。
第二十四条 实施项目一经审核批准，不得调整。如遇特殊情况调整或变动已批准的项目或内容，须由省级文物、财政部门提出申请，经国家文物局、财政部批准后方能调整和实施。
第二十五条 专项经费实行“专项申请，逐项核定，国库支付，按年度拨款，年终核销支出，项目完成后结报”的财务管理办法。按照规定需实行政府采购的，经费拨付按照政策采购办法执行。
