本监控规划的建立与实施除以我国的有关法律、法规和兽药使用规定为依据外，也尽量符合进口国法规要求，并通过相应的行政指令予以保证。
4.管理与组织机构
我国的动物及动物源食品残留物监控工作由农业部及所属机构承担，国家出入境检验检疫局及其分支机构承担进出口动物源性食品的残留的检测工作。其年度报告将于次年7月1日前发表。
农业部和国家出入境检验检疫局成立专家协调工作组，负责全国有害物质残留监控规划及年度监控计划，并负责有关监控信息的交流，根据监控结果准备并起草年度监控报告。
农业部邀请其他有关部门专家，成立全国药物残留监控专家委员会。
4.1 全国药物残留监控专家委员会职责
全国药物残留监控专家委员会根据
(1)国内药品使用情况及有关环保监控信息；
(2)地方残留监控机构的数据及农、兽药销售和使用等方面信息；评估残留监控计划的效果及效率，进行必要调整；
该委员会同时负责与相关国际专业组织进行对话，并负责拟订、审议和修改全国残留年度监控计划。
4.2 农业部负责全国兽药在动物性食品中的残留控制工作；制定、修订有关兽药残留法规、规定；发布兽药残留限量标准、检验方法等技术规定；发布兽药残留监控计划和年度监控计划；负责兽药残留工作的组织、协调、监督等管理工作。
4.3 国家出入境检验检疫局负责制定国家进出口动物产品的药物残留检测方法的标准、进出口动物产品的检测和监督管理。制订国家残留监控计划中针对进出口动物及动物产品的残留监控计划，并负责对进出口动物产品检验和监管工作。
4.4 地方残留监控机构
4.4.1 地方畜牧部门
1)各省(市)、自治区农牧厅(局)负责协调本辖区内残留监控计划的实施；
2)各省(市)、自治区兽药监察所及动物防疫部门负责：
——执行国内消费的动物和动物产品中残留检测任务；
——对本地兽药和饲料药物添加剂生产厂进行检查和监督；
——在当地农场进行残留监控和检查；
——采集国内市场的农场和屠宰厂样品。
4.4.2 地方检验检疫部门(地方CIQ)
