省级农发机构应按照国家农发办规定的时间向国家农发办申报项目年度实施计划或备案其批复的项目年度实施计划，国家农发办应及时批复或核查。国家农发办对省级农发机构报送备案的项目年度实施计划在一个月内未提出异议的，视为同意。批复或备案的年度项目实施计划，作为拨借中央财政资金和进行检查验收的依据。
第四十四条 年度项目实施计划进行调整、变更和终止的，应按照以下规定进行。
（一）凡建设内容调整涉及财政资金额度达到100万元以上的，应在项目初步设计重新审定后逐级报经国家农发办批准；低于100万元的，应由组织审定该项目初步设计的省级或地级农发机构批准。
（二）项目变更（指项目性质、建设地点、项目实施单位的任何一项变更）或终止，须逐级报经组织该项目评估审定的国家农发办或省级农发机构批准。由省级农发机构批准变更或终止的项目，需报国家农发办备案。因项目变更而实施的新项目需按本办法第三十四条第二款的规定附报新建单位相关证明材料。
（三）项目变更、终止经国家农发办或省级农发机构批准后，县级农发机构应及时将项目变更或终止的决定正式通知项目实施单位或农民，并说明变更或终止的理由。
（四）经批准终止的项目的中央财政资金，县级农发机构须在收到项目终止正式通知一个月内逐级上缴国家农发办。
（五）终止项目及因项目变更取消的项目，其已发生的有关费用支出，原则上由项目实施单位自行负担。
（六）所有项目的调整、变更或终止，应在项目立项当年年底或次年6月底之前集中申报，逾期由国家农发办逐级收回资金。
第四十五条 农业综合开发项目建设期为1-2年。凡纳入计划的项目，应如期建成，并达到国家规定的建设标准。
第四十六条 农业综合开发项目应当推行项目法人制、招投标制、工程监理制、资金和项目公示制。
土地治理项目主要单项工程的勘察设计、施工、监理、主要设备和材料的采购，实行公开招标。主要单项工程的施工，由具备相应资质或能力的单位进行监理。
农业综合开发财政资金及农村集体、农民自筹资金使用情况，项目建设主要内容，应推行公示制。
第四十七条 项目实施单位应按照经批准的初步设计组织实施，施工单位应严格按照设计图纸施工，不得擅自变更建设地点、规模、标准和主要建设内容。
第四十八条 各级农发机构要加强项目实施过程中的检查监督，进行定期检查或专项检查，发现问题及时纠正，确保工程质量和资金使用效益。
第四十九条 省级农发机构应在每年3月底前向国家农发办报送上年度项目实施计划完成情况统计表。
