申报材料简单粗糙，保护区技术人员业务水平不高；申报书有些内容不实。其经费紧张，但生态旅游年产值达60万元，两者如何协调；保护区内有两个乡，其缓冲区、核心区内人口较多。
十九、广西千家洞自然保护区
保护区水源丰富，水电站建设需要关注；保护区内旅游开发强度过大。
二十、广西九万山自然保护区
保护区属三个县林业局，如何协调；管理局级别未确定。
二十一、四川米仓山自然保护区
人口较多，虽已有搬迁计划，但未明确时间表；保护区是否与观雾山风景区有交叉。
二十二、四川雪宝顶自然保护区
管理力量不足，运行经费缺乏；进入保护区采摘、偷猎现象普遍，建议加强保护措施；区内存在放牧现象，周边还有开采钨矿等开矿现象。
二十三、云南永德大雪山自然保护区
保护区晋升后将管理局移至县城内，不利于管理保护；规划中将避雷设施建在山头，对于森林防火作用不大；保护区管理手段落后，基础设施缺乏。
二十四、云南会泽黑颈鹤自然保护区
管理人员偏少，经费紧张；核心区存在农业活动，影响黑颈鹤等栖息安全；规划要恢复草地，将防护林砍掉，应慎重；科研监测中应加强鱼类调查。
二十五、陕西子午岭自然保护区
核心区区划不合理，过境公路如何处理。
二十六、甘肃盐池湾自然保护区
农业部已将保护区所在县列入重点草原建设规划，两者需要协调；依据《
草原法》，草原的土地证早已发给当地牧民，而材料中仅仅说明林权归保护区，回避草原土地权属矛盾。如草原权属问题无法解决，可能会影响到牧民的生产生活；草原鼠兔对草原危害问题应该重视；面对保护区130多万公顷面积，管理人员仅有10人，管理力量单薄，建议相关部门增加编制和加强管理措施或缩小保护区面积。
二十七、甘肃安南坝野骆驼自然保护区
