第二十三条 凡涉及项目实质性问题（指获奖项目是否达到奖励条件、等级或有否弊端等）的争议，由有关专业评组提出处理意见报评委会办公室；推荐为三等奖的项目的争议，由三等奖预审核会裁决，推荐为特等奖和一、二等奖的项目的争议，由部评委会裁决。
第二十四条 为及时解决争议问题，部评委会办公室和各评审组办事机构接到争议函件后，应及时把争议的意见通知有关单位，并要求在限期内作出答复，逾期不作答复，作弃权论。涉及项目争议的有关各方，对争议处理应持积极态度，不得延误。自公布之日起两个月内争议仍未处理完毕，则取消该项目当年的获奖资格。
第二十五条 参加处理项目争议的单位和工作人员，要以对国家、对人民负责的态度，严肃认真，秉公办理，实事求是地做出公正的结论。
第二十六条 如发现弄虚作假或剽窃他人成果者，不受异议期限制，凡经查实证据确凿的，经部评委会批准撤销其奖励。追回奖金及荣誉证书，并按情节轻重给予批评或处分。
第七章 奖金的分配
第二十七条 获奖项目的奖金，应按以下原则进行分配：
一、不搞平均主义。获奖项目的奖金分配应按项目完成人的贡献大小，合理分配，贡献大的应多奖或重奖。项目主要完成人员所得奖金，一般不应低于项目奖金总额的５０％－７０％。
二、获奖项目的奖金不得重复发放。获奖项目如已获得过某一级的奖励，并分得了奖金，后又获更高一级别的奖励时，只补发高于原奖励金额的差额部分。
第二十八条 获部科技进步奖项目的奖金分配方案，应报部评委会办公室备案。
第二十九条 根据国家有关规定，获部科技进步奖项目的奖金，不计入单位的奖金总额，不征收奖金税。
第八章 附 则
第三十条 申报部科技进步奖的项目，主要完成单位每项需交纳的评审费８０元，个人申报交纳评审费８元，用于支付专业评审组和部评委会评审科技进步奖的活动经费。
第三十一条 本办法下列用语的含义是：
