一、全额预算管理。对没有收入或收入较少的事业单位，其各项支出全部纳入国家预算，由国家预算拨款，实行预算包干和增收节支分成的办法。对其稳定性的收入，如疗养院、水利工程管理单位的收入等，经批准可转作预算内收入，实行抵顶预算拨款的办法。
二、差额预算管理。对有经常性、稳定性收入来源且收入较多的事业单位实行“定额（定项）补助（或定额上交），增收节支留用，减收超支不补”的办法。
三、自收自支管理。对经济能够自立，上级不需核拨事业费的事业单位，实行自收自支的管理办法。有条件的，经批准可实行企业化管理，执行国家对企业的有关规定，不再享受事业单位的待遇。凡未经批准转为企业化管理的单位，不能享受企业待遇。不允许一个单位既享受事业待遇，又享受企业待遇。
第十一条 事业单位收支预算的编审程序采取“二上二下”的办法：
一、各主管机构和部直属其他事业单位应于十一月十五日前向部编报下一年度收支预算指标建议数，经部审核汇总报财政部。
二、部根据财政部核定的预算拨款指标控制数和各单位的建议数，下达各单位年度预算拨款指标和收入预算指标。
三、各单位按部下达的预算拨款指标和收入预算指标编制年度收支预算，逐级审核汇总报部。
四、各流域机构、电管局、直属省电力局、规划院、物资局（以下简称主管机构）所属单位的收支预算，由各主管机构审批。其他单位的收支预算，由部审批。
由于事业计划调整，需要增加或减少事业费预算时，应编报追加或追减预算，按预算编审程序上报审批。单位隶属关系改变时，其年度预算应同时划转。
第十二条 收支预算的编制应贯彻以下原则：
一、“讲求效益”的原则。编制收支预算，要贯彻党和国家关于发展经济的路线、方针和政策，讲求经济效益和社会效益，把资金用到刀刃上，做到少花钱、多办事、办好事。对重要项目的收支，要进行预测、决策，选择最佳方案，力求以最少消耗取得最大的经济成果。
二、“开源节流，量入为出”的原则。编制收支预算要根据党和国家关于“增产节约、增收节支”，“艰苦奋斗，勤俭建国”和“勤俭办一切事业”的方针，做到收入预算打得积极可靠，支出预算打得节约合理，不留缺口，不先斩后奏。反对讲排场、摆阔气，充分挖掘内部潜力，努力寻求增产节约和增收节支的有效途径。
三、“从实际出发，统筹安排，保证重点，兼顾一般”的原则。编制收支预算，要从本单位的实际情况出发，正确处理需要与可能的关系。根据单位的各项收入来源，统筹安排各项支出，对各项收支进行综合平衡。同时，根据“适当集中”的原则，集中必要的财力，有计划、有重点地进行分配，保证重点项目的资金需要，解决急需解决的关键性问题。
第十三条 各级主管机构对所属单位的收支预算应进行认真审核和汇总，对发现的问题，应与有关方面进行商议，及时加以纠正和解决。审核的主要内容是：
