第五条 基金项目的组织实施和经费管理应充分发挥基金制管理的优越性，贯彻“依靠专家、发扬民主、择优支持、公正合理”的原则。
第六条 自然科学基金委建立基金项目库，并按规定进行管理。
第七条 自然科学基金委会同教育部、财政部制定适合基金特点的项目资助经费绩效考评办法，对项目的实施及经费使用效益进行考评。
第二章 支持方向与开支范围
第八条 基金主要用于支持教育部批准的国家理科基础科学人才培养基地（以下简称基地）的建设，重点支持高水平、高质量基础科学后备人才的培养，其经费不少于基金资助经费总额的90％；适当资助特殊学科点的基础科学人才培养。
第九条 项目资助经费的具体开支范围：
（一）基地建设经费。主要用于资助国家理科基地本科生教学、实验和实习条件的建设，图书资料购置，骨干教师的培训，课程体系和教学方法的研究与改革所需的经费。
1．教学、实验和实习费：是指与教学、实验和实习直接有关的教学设备、教学软件、实验仪器与材料、实习设备、图书资料等所需支出的费用。
2．教学研究及骨干教师培训费：基地课程体系和教学方法研究与改革费、教材编写与出版费、骨干教师业务和外语培训费等。
（二）教学改革研究专项经费。用于教育部批准立项的“国家理科基地教改项目”、“国家理科创建名牌课程项目”的研究与实践。
1．资料、课件制作及教材出版费：开展项目研究所需的资料收集、复印、翻拍、翻译等费用，为制作多媒体课件支出的费用；教材的编写、出版费用。
2．调研差旅费：为了完成项目研究工作而进行的国内调研活动开支的差旅费，其标准参照国家有关规定执行。
（三）特殊学科点专项经费。主要用于特殊学科点学科带头人及后备人才培养所需的科研业务费，包括科研测试费、资料购置费、学术活动费、实验标本、试剂和药品的购置及保管费、实验样品分析费等。
第三章 项目资助经费的申请、审批和拨付
第十条 基地和特殊学科点均可向自然科学基金委提出资助申请，按规定如实填写《国家基础科学人才培养基金申请书》（以下简称申请书）并报自然科学基金委。受资助单位名称、银行账户等信息发生变更，应及时通报自然科学基金委。《申请书》格式由自然科学基金委制定。
第十一条 自然科学基金委与教育部联合组织专家组对基地、特殊学科点提出的申请项目进行评审，根据为期五年的基地、特殊学科点建设的目标规模、实际需求和财力可能，确定前两年的资助额度并报管理委员会批准后，由自然科学基金委下达经费额度。
