采取分段连续培养，直接攻读博士学位的方法。
第一阶段：一般２年。轮回参加本学科各主要专科方向的临床医疗工作，进行严格的临床工作训练，同时参加学位课程学习。经严格的临床业务技能考核和学位课程考试，择优升入第二阶段学习。
第二阶段：一般２至３年。学完全部学位课程，在广泛奠定本学科各种诊治技能和专业知识的基础上，进一步深入学习和掌握本专业临床技能和理论知识，逐步学会独立处理本学科常见病及某些疑难病症；参加临床教学工作，结合临床工作进行科研训练，完成一篇有一定水平的学位论文。
学位课程的学习和论文工作量的累积时间一般为两年左右。
对少数优秀住院医师及已获得医学硕士学位者，入学后可酌情免修某些学位课程或缩减某些临床工作训练。
五、学位课程
学位课程包括马列主义理论课、外语、专业基础课和专业课等，一般不少于五门。
结合所学专业及临床工作的需要，可以规定学习少量反映国内外先进医学水平的本专业和相关专业的选修课程。
学习方式以自学为主，并可逐步试行学分制。
六、阶段考核
实行筛选制度。
１．研究生完成第一阶段的临床工作训练后，由博士生指导教师及本学科的教授、副教授（研究员、主任医师、副研究员、副主任医师）３至５人组成考核小组，对研究生的临床业务技能、工作表现、学位课程等进行严格的综合考核或考试，择优选拔研究生升入第二阶段学习；
２．对其它未升入第二阶段的研究生，其学位课程考试成绩合格，经本人申请，导师和指导小组同意，可以适当延长学习期限，补修有关课程，完成一篇硕士学位论文，经答辩合格的，授予医学硕士学位；
３．未达到考核或考试标准者，应终止学习，发给临床医学研究生第一阶段结业证书。
七、学位授予
研究生完成第一、第二阶段的学习，通过全部学位课程考试，成绩优良，临床实际工作能力达到标准和完成学位论文后，经博士生指导教师推荐，由本学科副教授（副研究员、副主任医师）以上五位专家（其中半数以上应是教授或相当专业技术职务的专家，并包括外单位专家１至２人）组成业务能力考核和论文答辩委员会，对其临床能力和学位论文进行考核和答辩，并采取无记名投票方式，经全体成员２／３以上同意，报学位评定委员会审查批准，授予医学博士（临床医学）学位。经考核和答辩，认为申请人未达到医学博士水平，但已达到硕士水平，本人尚未获得硕士学位的，可以作出授予医学硕士学位的决定，报学位评定委员会审查批准。
