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鼓励科学家充分发挥想象力和创造力，自由探索未知世界，倡导发现新事实、新理论、新规律、新方法的活动，支持具备新思想、新方法以及可能产生新成果的基础理论研究；持续稳定地支持具有创新思想、掌握创新方法的优秀科研人员开展研究工作。
（三）提高国防科技自主创新能力，增强国防建设的科技支撑
“十五”期间，在中央确定的新时期军事战略方针指导下，国防科技发展要紧密围绕确保国家安全和国家领土完整的战略目标，重点提高我国国防科技的自主发展和创新能力，在未来高技术战争中取得技术制高点，提高我国武器装备的总体技术水平，加速推动国防装备的更新换代。在武器装备的关键技术领域和重大基础性技术领域，实现跨越发展，为我国新一代国防装备的发展提供技术支撑。大力发展军民两用技术，优先发展具有较大潜在民用前景的高新技术，初步建立军民结合、寓军于民的国防科技研究开发的良性运行机制，实现国防科技与民用科技的双向转移和互动发展，促进国防科技工业新体系的形成。
（四）深化科技体制改革，建设国家创新体系
“十五”期间，科技体制改革的总体目标是进一步解放科技生产力，初步建立符合社会主义市场经济要求和科技自身发展规律，充满活力的国家创新体系，为科技生产力的更大发展奠定坚实的制度基础。科技体制改革的重点是优化科技力量布局，合理配置科技创新资源，进一步解决科技与经济脱节问题，解决科研领域内的部门所有和单位分割等问题，加强科技创新机构建设，以体制创新为动力，促进科技与经济、科技与教育、民用科技与国防科技的互动与合作，完善创新活动的运行机制，坚持集成创新，扩大科技对外开放与交流，保持创新活动与社会经济环境相协调。
“十五”期间，进一步加强科学研究体系、技术开发体系、科技服务体系建设，加强产学研联合，形成以企业为主体，科研机构、高校、中介服务机构和政府机构相互连动的创新网络及运行机制。继续推进科研机构改革，技术开发类科研机构在全部完成企业化转制的基础上，不断深化内部组织结构、人员结构和专业结构调整，以产权制度改革为重点，全面实现企业化运行机制，加快建立现代企业制度。以人事制度和分配制度为重点，深化科研事业单位改革，抓紧建立并落实以社会保障、税收优惠和非营利组织建设为核心的体制改革配套政策。社会公益型科研机构按照分类改革原则，完成体制转轨的任务；中科院所属科研机构的改革按照“知识创新试点工程”的要求进行；主要侧重于社会科学领域的部门属科研机构，按照国家关于其他类型事业单位的改革部署进行改革。力争在“十五”期间基本建立起新型科技体制，为初步建立国家创新体系奠定基础。
--继续实施技术创新工程，推动企业成为技术进步和创新的主体。“十五”期间，以提高企业的技术创新能力与核心竞争力为目标，大力促进以技术开发中心为主要方式的企业技术创新体系建设，形成产学研联合的机制，推动大型企业和企业集团成为我国参与国际竞争的主要力量。建立为中小企业服务的技术创新支持系统，提高中小企业创新能力。把体制改革、加强管理与技术创新有机结合起，完善技术创新机制，抓好一批技术创新试点企业，建设一批开放式的行业共性技术的开发基地和重大成套技术装备制造基地，加速科技成果向现实生产力的转化，促进产业技术升级。
--继续推进知识创新工程，发挥大学和科研机构的创新源作用。建立国家知识创新体系，推进知识创新工程。发挥大学和科研机构在培养优秀创新人才方面的作用，实施高层次创新人才工程，形成一支精干、高水平的骨干科技人员队伍。加强大学和科研机构的基础研究和高新技术研究，促进大学和科研机构的联合，形成一批具有国际影响的科学研究机构。采用多种形式的共建共管，在重点大学和科研机构组建一批行业性或区域性的科学研究基地。
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